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鸡mir-1644基因“seed”区的T>C多态分析

文献类型: 中文期刊

作者: 耿立英 1 ; 张传生 2 ; 尹春光 2 ; 曹顶国 2 ; 杜立新 2 ; 陈娟 2 ;

作者机构: 1.河北科技师范学院

2.河北科技师范学院;济宁学院;山东省农业科学院家禽研究所;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

关键词: 鸡;mir-1644;seed;单核苷酸多态

期刊名称: 中国农业科学

ISSN: 0578-1752

年卷期: 2011 年 44 卷 13 期

页码: 2808-2813

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】观察"seed"区T>C多态对鸡mir-1644基因"茎环"结构和靶基因选择的影响,分析其在不同鸡群的遗传分布,为揭示其对mir-1644表达调控的影响及表型效应奠定基础。【方法】利用mfold和miRanda软件进行mir-1644二级结构模拟和靶基因预测,采用引入酶切位点RFLP技术对6个鸡群的179个个体进行基因型检测。【结果】①T→C突变可导致pre-mir-1644空间构型和自由能改变,稳定性降低;②预测到21个mir-1644-T和mir-1644-C基因差异调控的靶基因。③在汶上芦花鸡群体内以C等位基因为优势基因,与其它鸡间的基因型分布存在显著差异(P<0.01)。【结论】"seed"区T>C突变可能干扰或破坏mir-1644基因的表达调控,且CC基因型可能与汶上芦花鸡某些表型变异有关。

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