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玉米TCP家族基因生物信息学鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王玉红 1 ; 徐立华 2 ; 李军 1 ;

作者机构： 1.山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室

2.山东省农业科学院玉米研究所

关键词： 生物信息学;TCP;玉米

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2014 年 04 期

页码： 1-6

摘要： TCP家族是一类与植物器官三维形态发育或细胞周期调控相关的转录因子。本研究通过SeqHunter2软件,在玉米基因组范围内进行TCP家族基因的搜索和鉴定。共鉴定了7个玉米TCP家族基因,并根据进化树拓扑结构将其分为两大类:ClassⅠ和ClassⅡ。通过玉米、拟南芥和水稻TCP家族的进化分析推测,玉米发生了特有的TCP家族基因扩增事件,这些物种分化后进化出的基因可能参与了玉米特有的生命活动或与玉米特有的生物特征相关。玉米7个TCP转录因子的保守基序在组成上存在差异,但均含有TCP家族中最保守的两个基序。

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