科研产出
NCBI和cDNA文库中栽培花生EST-SSR分子标记的开发及其特点(英文)
《分子植物育种 》 2009 CSCD
摘要：本研究利用NCBI的GenBank数据库中公布的花生86132条EST序列以及利用高油酸品种E12所创建的cDNA文库中的12501条EST序列,对这些序列进行前期处理,总共获得非冗余且拼接较长的singleton11260条,contig9972条。通过MISA软件分析发现两个EST库中共包含有3104个SSR位点,占到总共非冗余序列的11.08%。这些SSR位点被分成二核苷酸重复、三核苷酸重复、四核苷酸重复、五核苷酸重复、六核苷酸重复以及混合核苷酸重复等,其中三核苷酸重复占的比例最多,分别占到NCBI和cDNA文库的43.0%和56.8%,二核苷酸和五核苷酸重复占到所有重复位点的第二位和第三位,六核苷酸重复的比例最少。在所有重复基序中,AG/TC重复的数量最多,分别占到NCBI和cDNA文库的8.65%和13.42%。在三核苷酸重复中,CTT/GAA出现的频率最大,分别占到6.7%和13.42%。所有这些SSR基序的长度在4～51个之间。
关键词： 花生 EST-SSR 开发 特点 NCBI和cDNA文库
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不同包膜控释肥对花生生物性状及养分含量的影响
《现代农业科技 》 2009
摘要：不同包膜控释肥对花生生物性状及养分含量的影响试验结果表明,与习惯施肥相比,不同包膜控释肥处理的花生单株果数增加16.67%～50.00%,花生果干重增加1.29%～16.34%,而在花生果鲜重、百粒重、出米率方面控释肥没有表现出明显的优势;包膜控释肥处理的花生秧单株干重增幅为1.13%～6.32%,在花生秧单位面积株数、株高、单株鲜重方面也无显著影响;在花生养分含量方面,施用包膜控释肥后,花生钾含量增加5.88%～14.71%,对花生氮、磷含量的影响不显著。
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花生中DREB类转录因子PNDREB1的克隆及鉴定
《作物学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：脱水响应元件结合因子(DREB)是一类对多个抗逆相关基因表达起调控作用的植物特有的转录因子,在植物抗逆能力综合改良方面具有重要作用。本研究通过筛选花生未成熟种子的cDNA文库,分离到一个DREB类基因——PNDREB1(FM955398)。该基因序列长度为687bp,推测编码蛋白含有229个氨基酸残基,相对分子量为24.7kD,理论等电点为5.97,与其他物种中该类转录因子序列同源性较高。利用酵母单杂交系统,对花生PNDREB1与DRE元件的特异识别和结合能力及其C-末端转录激活活性进行检测,显示,转入含有该基因及阳性对照基因的载体均可使酵母菌株正常生长,且具有显色反应,而转入空载体的酵母菌株不能生长,证明基因PNDREB1中的AP2结构域具有和DRE元件特异性结合的能力;同时,只有转入含有该基因C-末端片段及阳性对照基因的载体可使酵母菌株正常生长,并具有显色反应,而转入空载体的酵母菌株不能生长,说明其C-末端片段具有转录激活活性,该基因为DREB类转录因子。基因表达模式分析显示,PNDREB1为组成型表达,且被低温强烈、迅速诱导表达,并对干旱胁迫也有一定程度的响应,但对高盐和ABA处理没有响应。
关键词： 花生 DREB类转录因子 PNDREB1 酵母单杂交 表达模式 低温 干旱
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利用嫁接提高花生离体再生或转基因苗成活率的研究
《中国农学通报 》 2009 北大核心
摘要：【研究目的】花生(Arachis hypogaea L.)是世界上重要的油料作物。近年来,花生分子生物学发展迅速,但低效的再生和遗传转化系统严重制约着利用基因工程改良花生品种的研究,该研究旨在利用嫁接的方法提高花生再生和转化苗的成活率,缩短再生周期。【研究方法】分别采用劈接、斜接、插接的方法将再生和转化的花生苗嫁接到实生花生砧木上。【研究结果】利用嫁接技术将组培苗或转基因苗嫁接到实生苗砧木上,不同嫁接方法成活率达到70%～100%,远远高于转基因幼苗直接诱导生根移栽的成活率。【主要结论】实验证明,嫁接可提高花生再生和转化苗的成活率,可广泛应用于花生基因工程育种研究中。
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SSR标记分析国家北方花生区试品种的遗传多样性
《植物遗传资源学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：利用10对SSR引物对参加我国北方区域试验的27份花生品种进行PCR扩增分析,共扩增出57条带,其中45条呈现多态,多态性比率为78.95%。引物的多态性信息含量(PIC)变幅为0.417~0.857,平均值为0.688。27个品种间的遗传相似系数在0.311~0.962之间,平均为0.651。聚类分析结果表明,27个参试花生品种在遗传相似系数0.61处分为3个类群,同一类型的参试品种优先聚为一类,同一地区或同一育种单位提供的品种往往首先聚为一类。系谱分析表明亲本来源相近的品种优先聚在一起,利用农家品种和辐照诱变材料对于拓宽花生遗传基础发挥作用较明显。SSR分析结果基本上与系谱相吻合。
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我国北方地区花生品种的遗传多样性分析
《中国农业科技导报 》 2009
摘要：利用SSR分子标记对我国北方地区育种品种以及区试品种共计68个栽培花生品种进行遗传多样性分析,结果表明,104对SSR引物中有15对在品种间存在多态,多态率为14.4%,平均每个标记产生3.8个位点。15对引物的多态信息量在0.397~0.667之间。山东地区花生品种的遗传多样性要高于我国北方其他地区供试品种。小粒组品种的遗传多样性要略高于大粒组品种。聚类分析表明我国北方68个育成和区试品种的遗传相似系数在0.64~0.91之间,分成两个大类,第一个大类可分成四小类,其中第三小类又可以分成六个亚类。这些结果表明我国北方地区现有育成和区试品种的遗传多样性较低,为拓宽花生育种的遗传基础,应从中发掘出有利用价值的品种。
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花生脂质转运蛋白家族基因的克隆与表达分析
《花生学报 》 2009
摘要：植物脂质转运蛋白(Lipid transfer protein,LTP)作为一类小分子碱性蛋白在脂类物质的运输、生殖发育,抵御不良环境等方面具有重要的作用,此外,LTP还作为一种过敏原存在。通过构建花生未成熟种子全长cDNA文库,克隆到了5类LTP基因,按照编码蛋白分子量的大小命名为AhLTP-11.5,AhLTP-12.8,AhLTP-11.8,AhLTP-8.3和AhLTP-19.2。生物信息学预测表明AhLTP-11.5属于AAI_LTSS蛋白家族的nsLTP1亚族,AhLTP-11.5编码蛋白的N端有26个氨基酸残基的信号肽序列,ProtCompv8.0预测结果显示该蛋白为分泌蛋白,胞外定位。从系统发育树中可以看出,花生的AhLTP-11.5和拟南芥的AthLTP亲缘关系较近。半定量RT-PCR结果表明AhLTP-11.5基因在花生茎、叶、花和种子中均有表达,在根中几乎检测不到;在花生种子的不同发育时期AhLTP-11.5基因在DAP15d时表达量较低,20d以后表达趋于稳定。
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IT-ISJ标记在花生上的应用研究
《花生学报 》 2009
摘要：首次报道了IT-ISJ标记在花生的应用效果。采用7对IT-ISJ引物扩增20份花生样品,扩增产物经变性聚丙烯酰胺电泳分离,银染显色。结果表明,每对引物扩增出来的条带数为5～18条,多在10条以上;能很好地揭示野生型花生与其突变体之间的遗传差异;花生野生种多态性程度最高,参试的栽培种四大类型品种,多态性率较低;作图亲本条带的多态性率居中,说明亲本间遗传差异较大,可满足作图需要。提示IT-ISJ标记在花生品种鉴定、突变体鉴定和图谱构建上具有较大应用潜力。
关键词： 花生 IT-ISJ标记 分子标记 内含子长度多态性
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