科研产出
花生乙酰辅酶A羧化酶家族基因在不同胁迫下的响应模式分析
《植物生理学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：乙酰辅酶A羧化酶（acetyl-CoA carboxylase, ACC）在植物中催化乙酰辅酶A生成丙二酰辅酶A,是脂肪酸合成的关键酶。为系统分析花生乙酰辅酶A羧化酶基因家族,对28个AhACC基因进行了生物信息学分析。结果表明, 28个AhACC基因分别编码异质型ACC的4个亚基BC、BCCP、α-CT、β-CT和同质型ACC,基因个数为7、13、4、2和2个,不均匀分布在15条染色体上,只有一个具有跨膜结构域。同质型AhACC外显子个数最多为32个, AhaccD外显子个数最少为1个。聚类分析表明, AhACC与大豆、苜蓿亲缘关系较近,编码花生BCCP亚基的基因数目最多。根据转录组数据发现, AhACC多存在于叶片和种子发育早期,在不同组织中有不同表达模式,另外AhACC在根中主要响应ABA胁迫,同质型AhACC对低温和盐胁迫有重要作用。从转录组数据库中挑选8个差异表达基因进行qRT-PCR验证,其表达趋势与测序结果相一致。8个差异表达的基因在ABA处理24 h后表达量全部上调; arahy.15M9SP和arahy.Y8HZNS在NaCl处理后表达量下调,其余6个表达量上调。
关键词： 栽培种花生 乙酰辅酶A羧化酶 非生物胁迫 表达模式
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燕山葡萄VyMAPK基因的克隆及表达分析
《植物生理学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：以燕山葡萄(Vitis yeshanensis)为材料,利用同源克隆技术获得2个MAPK基因的全长cDNA序列,分别为VyMAPK1和Vy MAPK9.其ORF为1 197和1 803 bp,分别编码398和600个氨基酸.生物信息学分析表明2个蛋白质均含有蛋白激酶结构域, VyMAPK1和VyMAPK9的同源性较低,仅有30.12%.利用荧光定量PCR进行表达模式研究,结果表明:Vy MAPK1和Vy MAPK9表达具有组织特异性, Vy MAPK1在卷须中高表达,而Vy MAPK9在根中高表达; VyMAPK1只响应IAA诱导,对其他植物生长调节剂诱导响应不明显,而VyMAPK9对IAA、6-BA、GA3、ABA、SA和MeJA等诱导有不同程度的响应.VyMAPK1和VyMAPK9均响应低温、高盐和干旱逆境.其中VyMAPK9基因的响应更为强烈,推测该基因在燕山葡萄的非生物胁迫过程中发挥重要的作用.
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脱落酸受体PYLs的结构与功能研究进展
《分子植物育种 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：脱落酸(abscisic acid, ABA)在响应生物及非生物胁迫和调控植物生长发育中发挥重要作用.ABA功能的发挥是通过一系列信号转导来实现的.ABA信号通路主要包括ABA受体PYR/PYL/RCAR、PP2C和SnRK2 3类核心组分.在ABA信号转导过程中,ABA受体PYLs作为ABA信号通路上游调控因子,首先感受ABA信号;然后,通过抑制PP2C磷酸酶活性进而激活SnRK2,促进下游基因表达,开启ABA信号通路,调控植物耐逆或生长发育.本研究主要对ABA信号通路,特别是PYLs蛋白的发现、结构及功能等方面进行了评述,并以棉花为例,对如何深化棉花PYLs蛋白功能研究作了展望.
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葡萄VQ motif-containing蛋白家族基因鉴定及其在胁迫响应中的作用研究
《中外葡萄与葡萄酒 》 2019
摘要：本研究鉴定出18个葡萄VQ motif-containing蛋白家族成员.18个葡萄VQ motif-containing蛋白家族成员可分为6个亚家族,并包含2个孤儿VQ motif-containing蛋白基因.很多葡萄VQ motif-containing蛋白基因的表达不仅受到非生物胁迫及外源ABA处理的影响,也可能受到葡萄CBF4基因的调控,还会受到病毒感染或白粉病感染的影响.通过比较易感病品种‘赤霞珠’和抗病品种‘诺顿’感染白粉病后VQ motif-containing蛋白基因的表达变化发现,二者中大部分相同VQ motif-containing蛋白基因的表达趋势一致.但是,VIT_213s0156g00160和VIT_201s0011g01350的表达变化趋势在二者之间不同.VIT_208s0007g05180和VIT_208s0058g00690可以与葡萄WRKY33互作,部分葡萄VQ motif-containing蛋白还可以与多个Sigma70_r2结构域包含蛋白互作.此外,葡萄VQ motif-containing蛋白家族在进化历史中主要遭受纯化选择.
关键词： 葡萄 VQ motif-containing蛋白 生物胁迫 非生物胁迫 WRKY转录因子
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甜樱桃砧木PcDHN1的克隆及其对非生物胁迫的响应
《核农学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：为明确甜樱桃砧木脱水素基因特征及其在干旱、高盐和低温胁迫过程中的表达模式,以甜樱桃砧木Y1为材料,利用RT-PCR和RACE技术克隆了甜樱桃砧木脱水素基因Pc DHN1,利用生物信息学分析其编码蛋白特征,并采用qRT-PCR分析该基因的表达模式。序列分析显示,甜樱桃砧木脱水素基因Pc DHN1的c DNA全长893 bp,编码225个氨基酸,推测编码蛋白分子量约为23.98 k D,理论等电点为8.65。氨基酸序列分析显示,Pc DHN1含有2个Y-片段、1个S-片段和2个K-片段,具有植物脱水素蛋白的特征性结构,属于YnSK2型脱水素。表达特性分析显示,Pc DHN1在干旱、高盐和低温胁迫条件下受胁迫诱导而上调表达,但对低温胁迫响应比较迟缓,说明该基因可能参与了甜樱桃砧木对干旱和高盐胁迫的耐受调节过程。本研究结果为甜樱桃砧木抗逆基因工程提供了一定的参考。
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全基因组范围葡萄热休克转录因子的鉴定与分析
《安徽农业科学 》 2017
摘要：[目的]从全基因组范围鉴定葡萄热休克转录因子基因家族,并对其基因结构、蛋白结构、基因启动子、基因在进化中受到的选择压力以及其编码基因在非生物胁迫下的表达变化进行综合分析,并对葡萄热休克转录因子基因家族的密码子使用偏好性进行研究,分析影响葡萄热休克转录因子基因家族密码子使用偏好性的因素。[方法]利用葡萄基因组数据库相关数据建库结合本地BLAST法鉴定序列,利用多重序列比对,进化树构建等生物信息学方法进行分析。[结果]鉴定了20个葡萄热休克转录因子,并将其分为4个亚组。其中9个热休克转录因子基因在冷胁迫1 h下表达上调,2个在冷胁迫4 h下表达上调。在高温胁迫14 d条件下,7个热休克转录因子基因表达量下调。在高温胁迫42 d条件下,8个热休克转录因子基因表达量下调。此外发现,葡萄热休克转录因子家族各成员基因存在密码子使用偏好性。[结论]该研究为深入研究葡萄热休克转录因子的功能提供了有用的信息。
关键词： 热休克转录因子 葡萄 非生物胁迫 选择压力 密码子偏好性
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小麦响应逆境胁迫的蛋白质组学研究进展
《麦类作物学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：小麦生长发育过程中会受到多种逆境胁迫的影响,在胁迫条件下,小麦可通过改变自身的蛋白质表达水平对各种胁迫作出响应。蛋白质组学研究能够全面揭示小麦响应胁迫时其细胞内蛋白质的动态变化规律,鉴定差异表达的蛋白质,并发现胁迫响应相关的标志物,是小麦抗逆生物学研究的重要组成部分。本文简要综述了蛋白质组学技术在小麦响应非生物(低温、高温、干旱、盐碱)和生物(病原菌)胁迫上的最新进展,并对其应用前景进行了展望,以期为深入研究小麦响应逆境胁迫的分子机制提供参考信息。
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番茄对非生物胁迫响应机制研究进展
《山东农业科学 》 2015
摘要：番茄是我国保护地种植经济效益较高的蔬菜,约占整个保护地蔬菜种植面积的30%,在设施蔬菜栽培中占有重要地位。不同非生物胁迫对番茄的生长发育、产量及果实品质等产生不同程度的影响。因此,了解番茄在不同非生物胁迫下的生命活动规律,对其抗逆育种和增产增收都具有十分重要的意义。本文综述了近年来番茄在生长发育、生理生化和基因调控方面对非生物胁迫响应机制的研究进展,并建议对番茄非生物胁迫响应机制的研究应上升到组学水平。
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