科研产出
牛HSFl和HSBPl基因多态性分析
《中国农业科技导报 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：利用DNA测序技术对牛HSFl和HSBPl进行SNPs位点扫描,共发现4个新SNPs,包括HSFl 1451(G/T)位点、HSBP1第二内含子324(G/C)、589(C/T)和651(C/G)位点.利用CRS-PCR和PCR-RFLP技术对867头荷斯坦牛、85头鲁西黄牛和28头渤海黑牛进行基因多态性分析.X2检验表明,HSFl 1 451(G/T)位点和HSBPl 589(C/T)位点在荷斯坦牛和鲁西黄牛群体中已达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),而HSBPl 324(G/C)和651(C/G)位点的突变在荷斯坦牛群中均未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05).HSFl 1 451位点(G/T)AA基因型频率最高,优势等位基因为A,而HSBPl 3个SNPs频率最高的基因型分别为AB、AA和BB,589(C/T)位点的优势等位基因为A,而324(G/C)和651(C/G)位点均为B.HSBP1 651(C/G)位点不同基因型的分布在三个牛品种中存在差异,在荷斯坦牛中AA型频率最低,而在鲁西黄牛和渤海黑牛中AA型频率最高,推测该基因型与耐热性有关.该结果将为奶牛耐热分子育种提供理论参考.
关键词： 牛 SNPs HSFl HSBPl CRS-PCR PCR-RFLP
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牛粗饲料品质评价指标研究进展
《中国草食动物 》 2011
摘要：粗饲料是牛日粮的重要组成部分,其品质对牛生产性能和健康有极大影响,而实际生产中往往做不到对其品质准确评价甚至忽略,进而影响养殖的经济效益。现有粗饲料品质评价指标有单项指标和综合指标,单项指标主要包括常规营养成分、干物质随意采食量、消化率等,综合指标则包括粗饲料相对值、品质指数、粗饲料相对品质指数、粗饲料分级指数等。现综述国内外现有评价粗饲料品质指标的研究进展,以期为研究人员进行牛粗饲料评价提供参考。
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牛Src基因三个内含子单核苷酸多态性
《华北农学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：采用巢式PCR、DNA测序、创造酶切位点法PCR(Created restriction site-PCR,CRS-PCR)及PCR-RFLP(Poly-merase chain reaction-restriction fragment length polymorphism assay)方法,研究中国荷斯坦牛、鲁西黄牛及渤海黑牛的Src基因内含子6,8,9的单核苷酸多态性(SNPs),发现了14062(C/T)、17302(G/A)和18107(T/C)共3个SNPs,均为首次报道的位点。Src基因14062(C/T)、17302(G/A)和18107(T/C)3个位点在中国荷斯坦牛和鲁西黄牛两个群体中的优势等位基因相同,分别为C、G、C,其等位基因频率分别为0.671/0.647、0.583/0.640、0.558/0.577,而渤海黑牛在这三个位点的优势等位基因分别为T、G、C,其等位基因频率分别为0.525,0.913,0.763。经χ2适合性检验,中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛三个群体在14062(C/T)位点均达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);在17302(G/A)位点则均未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05);中国荷斯坦牛和鲁西黄牛在18107(T/C)位点均达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),而渤海黑牛未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。中国荷斯坦牛和鲁西黄牛在14062(C/T)和18107(T/C)位点均表现为中度多态(0.25
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牛SLC11A1基因多态性分析
《中国兽医学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：本研究采用巢氏PCR、降落PCR技术扩增牛SLC11A1基因的内含子9和11,分别获得777、715bp的片段,利用DNA测序技术对这2片段测序,发现3个新SNPs,分别为内含子9的6067(A/G)、6358(C/T)和内含子11的7809(A/T)。同时利用CRS-PCR和PCR-RFLP方法对这3个SNPs进行基因型分型,分析944头中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛的SLC11A1基因的多态性。结果表明,SLC11A1基因的3个SNPs的AA基因型频率最高,优势等位基因均为A;适合性检验表明,6358(C/T)和7809(A/T)位点在中国荷斯坦牛与鲁西黄牛群体中已达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),而6067(A/G)位点的突变在牛群中均未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05);同时中国荷斯坦牛群体在这3个基因座位上的多态信息含量均大于鲁西黄牛与渤海黑牛。
关键词： 牛 SNPs SLC11A1基因多态性 CRS-PCR PCR-RFLP
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牛LAP3基因内含子12和外显子13单核苷酸多态性
《中国农业科技导报 》 2010
摘要：采用单链构象多态性(single-strand conformation polymorphism,SSCP)、创造酶切位点PCR(createdrestriction site-PCR,CRS-PCR)、限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)以及直接测序方法,研究中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛LAP3基因第12内含子和第13外显子的单核苷酸多态性(SNP)。共检测到5个SNP,分别为24 794(T/G)、24 803(T/C)、24 846(T/C)、24 564(G/A)和25 415(T/C),其中24 564(G/A)为首次报道的位点。经PCR-SSCP结合测序图谱发现24 794(T/G)、24 803(T/C)、24 846(T/C)位点完全连锁,但该连锁位点在鲁西黄牛群体中未检测到。5个SNP位点在中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛群体的优势等位基因相同,分别是T、T、T、G、T,其等位基因频率分别是T(CH0.579/LY 1/BB 0.722)、T(CH0.579/LY1/BB 0.722)、T(CH0.579/LY1/BB 0.722)、G(CH0.584/LY0.775/BB 0.500)和T(CH0.596/LY 0.796/BB 0.750),多态信息含量均在0.25至0.5之间,属于中度多态。
关键词： 牛 LAP3基因 单核苷酸多态性 单链构象多态性 优势等位基因
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牛AR基因5′UTR SNP分析及与精液品质关系
《吉林农业大学学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：采用PCR-SSCP方法对种公牛群体雄激素受体(AR)基因5′非翻译区(5′UTR)多态性进行检测。结果表明:AR基因5′UTR含有多态性位点;测序结果显示5′UTR的-1575处存在T→G碱基突变;用最小二乘方法对该基因型与生产性状相关分析显示遗传多态性与精子密度性状呈显著相关,AA型显著高于AB型(P=0.025),对其他性状的影响差异不显著。试验为研究种公牛体内AR基因的生物学作用奠定了基础,为肉用种公牛的早期选种选育提供了候选基因和分子标记。
关键词： 牛 雄激素受体基因 5′非翻译区 SNP分析 精液品质
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去乙酰化酶1基因对牛前体脂肪细胞凋亡影响的研究
《生物化学与生物物理进展 》 2010 SCI 北大核心 CSCD
摘要：去乙酰化酶1(sirtuin type1,SIRTl)是一个新的脂肪细胞调控因子,通过与其靶基因叉头转录因子1(the forkhead box O family1,FoxO1)相互作用,参与细胞增殖、分化、衰老、凋亡和代谢过程.利用吖啶橙(acridine orange,AO)染色、流式细胞仪、荧光定量PCR(quantitative real-timePCR,qPCR)等技术方法,研究SIRT1的抑制剂———烟酸胺(nicotinamide,NAM)处理后对鲁西黄牛皮下前体脂肪细胞(bovine subcutaneous preadipocytes,BSP)和肌内前体脂肪细胞(bovine intramuscular preadipocytes,BIP)凋亡的影响.观察了BSP和BIP的凋亡形态;比较了SIRT1基因抑制后,相关基因如FoxO1等在两种细胞之间的表达差异.结果表明,NAM对BSP和BIP细胞表现出相同的生长抑制作用,处理组的BSP和BIP细胞的凋亡率均显著高于对照组,其作用可能通过抑制SIRT1,激活FoxO1凋亡通路实现.SIRT1及其相关基因对BSP和BIP的调控存在不同途径.
关键词： 去乙酰化酶1(SIRT1) 烟酰胺 牛 前体脂肪细胞 凋亡
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牛趋化因子受体基因1第2外显子的单核苷酸多态性分析
《中国畜牧兽医 》 2010 北大核心
摘要：采用DNA测序、巢氏PCR和CRS-PCR方法对中国荷斯坦牛、鲁西黄牛、渤海黑牛的趋化因子受体基因1(CXCR1)的单核苷酸多态性(SNPs)进行研究,在第2外显子上发现了4个SNPs,分别为291 bp(C/T)、333 bp(C/T)、337 bp(A/G)和365 bp(C/T),这4个位点在中国荷斯坦牛、鲁西黄牛、渤海黑牛群体中均达到中度多态(0.25
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三个牛品种MBL1基因第一内含子与第二外显子遗传多态性研究
《中国农业科技导报 》 2010
摘要：采用巢式PCR、DNA测序和CRS-PCR方法,研究中国荷斯坦牛、鲁西黄牛、渤海黑牛的MBL1基因内含子1和外显子2的单核苷酸多态性(SNPs),发现了855(G/A)、2651(G/A)和2686(T/C)3个新SNP位点。855(G/A)位于内含子1上,2651(G/A)导致Val24 Ile氨基酸的改变,2686(T/C)为同义突变。3个SNP位点在3个牛品种群体中优势等位基因相同,分别为G、G、C,其等位基因频率分别为0.87/0.58/0.57、1/0.75/0.74、1/0.76/0.63。经χ2适合性检验,荷斯坦牛在855(G/A)位点、鲁西黄牛在855(G/A)、2651(G/A)位点、渤海黑牛的所有位点达到Hardy-W e inberg平衡状态(P>0.05)。3个牛品种在855(G/A)位点均表现为低度多态;在2651(G/A)和2686(T/C)位点均表现为中度多态(0.25 全文链接
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牛糖基化依赖细胞黏附分子1基因(GlyCAM1)的遗传多态性分析
《农业生物技术学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：以中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛为研究材料,利用CRS-PCR、PCR-SSCP及DNA测序技术检测了糖基化依赖细胞黏附分子1基因(GlyCAM1)的遗传多态性。结果表明,在牛GlyCAM1基因外显子3的第2081(A/C)和内含子3的2417(C/T)位点存在突变,两位点在3个牛群中的等位基因频率A/B分别为0.7525/0.2475、0.6112/0.3888和0.3375/0.6625;0.9046/0.0954、0.8383/0.1617和0.7875/0.2125;经χ2适合性检验,3个牛群在内含子3的突变达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),在外显子3鲁西黄牛和渤海黑牛达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),中国荷斯坦牛的突变在此位点未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。
关键词： 牛 糖基化依赖细胞粘附分子1基因(GlyCAM1) 遗传多态性 CRS-PCR PCR-SSCP
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