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关键词:SNP分析(模糊匹配)
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希尔斯山羊草1SsS和3SsS染色体特异dCAPS标记的建立

山东农业科学 2023

摘要:希尔斯山羊草是小麦的近缘种,具有抗病、抗逆、抗虫等优异性状,是小麦遗传改良的珍贵基因源。当前,我们创制了一批小麦-希尔斯山羊草杂交种质。然而,由于缺乏分子标记,上述种质无法被有效筛选和鉴定。为了建立希尔斯山羊草染色体特异分子标记,本研究通过对希尔斯山羊草基因组重测序,发掘希尔斯山羊草和小麦间单核苷酸多态性(SNP),选择150个多态性位点开发dCAPS标记,结果发现,相比中国春等小麦对照,利用引物AESD23和AESD105经PCR和酶切电泳后分别能在希尔斯山羊草中获得长度不同的多态性条带。利用一套中国春-希尔斯山羊草二体附加系和端体附加系对这些多态性条带进行定位,结果发现,AESD23能在中国春-希尔斯山羊草1Ss二体附加系和1SsS端体附加系中扩增出长度为1 800 bp的多态性条带,而AESD105能在中国春-希尔斯山羊草3Ss二体附加系和3SsS端体附加系中扩增出长度为200 bp和300 bp的多态性条带。对小麦-希尔斯山羊草杂交种质检测发现,AESD23和AESD105均能对小麦-希尔斯山羊草杂交种质进行有效筛选和鉴定。因此,上述3个多态性片段可以作为dCAPS标记用于检测含希尔斯山羊草1SsS或3SsS染色质的材料,为检测和追踪小麦背景中希尔斯山羊草染色质提供了新的检测手段。

关键词: 小麦 希尔斯山羊草 基因组重测序 SNP分析 dCAPS标记

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牛AR基因5′UTR SNP分析及与精液品质关系

吉林农业大学学报 2010 北大核心 CSCD

摘要:采用PCR-SSCP方法对种公牛群体雄激素受体(AR)基因5′非翻译区(5′UTR)多态性进行检测。结果表明:AR基因5′UTR含有多态性位点;测序结果显示5′UTR的-1575处存在T→G碱基突变;用最小二乘方法对该基因型与生产性状相关分析显示遗传多态性与精子密度性状呈显著相关,AA型显著高于AB型(P=0.025),对其他性状的影响差异不显著。试验为研究种公牛体内AR基因的生物学作用奠定了基础,为肉用种公牛的早期选种选育提供了候选基因和分子标记。

关键词: 雄激素受体基因 5′非翻译区 SNP分析 精液品质

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