科研产出
高通量检测花生油酸含量相关基因AhFAD2等位变异的方法
《农业生物技术学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：花生(Arachis hypogaea)Δ12脂肪酸去饱和酶基因(Δ12fatty acid desaturase,Ah FAD2A和Ah FAD2B)是决定花生籽粒油酸含量和高油酸亚油酸比值(oleic acid/linoleic acid,O/L)的关键基因,高油酸花生品种中这2个基因均发生突变。针对普通油酸花生和高油酸花生Ah FAD2A 448位G/A差异和Ah FAD2B 442位A碱基的插入/缺失(insertion-deletion,In Dels)等位差异,已开发了包括酶切扩增多态性序列法(cleaved amplified polymorphic sequence,CAPS)和等位基因特异PCR(allele-specific PCR,AS-PCR)等多种检测的标记和检测方法。本研究针对上述2个SNP位点,开发了可进行高通量检测的实时定量PCR引物、Taq Man探针和检测技术,该方法检测效率和准确率均很高。本研究还开发了更为经济和高效的竞争性等位基因特异性PCR(kompetitive allele specific PCR,KASP)引物和检测方法。利用开发的Taq Man探针检测方法和KASP方法检测了14个花生品种和高油酸选育回交组合BC2F1和BC1F2群体部分种子的基因型,并比较了两种方法检测结果的一致率,发现这两种方法检测Ah FAD2B 442 nt A/-In Del差异结果的一致率高达96.7%;而针对Ah FAD2A 448位G/A差异位点检测一致率仅为71.7%。本研究还比较了目前常用的CAPS、AS-PCR、测序法、Taq Man探针法及KASP方法的优缺点,对相关方法的应用前景进行了讨论。本研究涉及的高通量检测方法可有效地辅助高油酸品种的选育,极大地提高了目标性状选择的准确性和效率。
关键词： 花生12脂肪酸去饱和酶基因(AhFAD2) 等位变异 油酸 检测方法 花生
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傅立叶近红外漫反射光谱技术在花生脂肪酸分析中的应用
《花生学报 》 2015
摘要：选取高油酸花生品系与普通油酸含量花生品种搭配的4个杂交组合共计987份F2种子,应用近红外反射光谱技术,结合偏最小二乘法,采用检验集检验,成功构建了花生油酸、亚油酸、棕榈酸、4种有害脂肪酸(棕榈酸、花生酸、山嵛酸、二十四碳烷酸)、碘值(IV)和不饱和脂肪酸/饱和脂肪酸(U/S)等6个近红外模型。各模型决定系数(R2)分别达到94.67、95.72、86.36、83.71、94.90和73.53,预测根均方差(RMSEP)分别为2.52、1.91、0.60、0.67、1.57和0.27。各模型预测偏差分别为-4.399~4.838、-2.011~1.874、-1.247~1.438、-1.634~1.420、-2.231~3.733、-0.533~1.396,预测相对误差分别为0.562~9.687、0.055~7.010、0.642~12.72、0.636~11.464、0.217~4.145、1.582~17.934。上述模型可用于花生种子脂肪酸快速分析预测,在花生脂肪酸品质育种、高油酸花生种子生产和原料花生质量控制中具有重要价值。
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花生自然风干种子油酸、亚油酸和棕榈酸含量的近红外分析模型构建
《中国农学通报 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：近红外光谱分析技术在作物育种中得到广泛应用。提高花生种子品质近红外分析技术,不断改进花生种子主要脂肪酸组分近红外模型,对深入开展花生品质育种具有重要意义。利用不同来源、不同种皮颜色的大粒型和小粒型材料,构建了花生自然风干种子油酸、亚油酸和棕榈酸含量的近红外定量分析模型。经优化,最佳光谱预处理方法均为"一阶导数+矢量归一化法",油酸含量谱区范围为8717.1～5446.3cm-(1厘米波数),维数为9,模型的决定系数(R2)为89.16,均方差(RMSECV)为2.62;花生种子亚油酸含量谱区范围为9666～5785.7cm-1,维数为9,模型R2为90.85,RMSECV为2.00;花生种子棕榈酸含量谱区范围为8717.1～5446.3cm-1,维数为8,模型R2为79.21,RMSECV为0.525。该模型可用于花生品质育种。
关键词： 花生 自然风干种子 油酸 亚油酸 棕榈酸 近红外定量分析模型
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傅立叶近红外漫反射非破坏性测定花生种子主要脂肪酸含量
《花生学报 》 2010
摘要：应用傅立叶变换近红外漫反射光谱技术非破坏性地快速定量分析了花生种子的油酸、亚油酸、棕榈酸等主要脂肪酸含量。建立的油酸、亚油酸、棕榈酸预测数学模型交叉验证的统计参数为:油酸的决定系数(R2)为98.74%,均方差(RMSECV)为1.87;亚油酸的决定系数(R2)为98.97%,均方差(RMSECV)为1.5;棕榈酸的决定系数(R2)为96.02,均方差(RMSECV)为0.52;硬脂酸的决定系数(R2)为73.91%,均方差(RMSECV)为0.37。分析结果的准确度接近常规化学方法,完全能满足花生品质育种的要求,并在遗传后代中筛选出油酸/亚油酸比值高达15.00以上的材料4份。高比值材料的油酸与亚油酸总和比一般花生品种高2个百分点以上,而棕榈酸含量低3个百分点多。
关键词： 近红外漫反射光谱 花生种子 油酸 亚油酸 棕榈酸 硬脂酸
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