科研产出
野生二粒小麦粒重相关基因GW2的克隆及其单倍型分析
《麦类作物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：野生二粒小麦作为普通小麦A、B基因组供体，具有遗传类型多、变异丰富，以及粒重、粒大、抗病、耐逆等优良特性，一直是小麦遗传改良重要的种质资源和基因库。GW2(grain width 2)基因是调控水稻、小麦等谷类作物籽粒重量和宽度的关键基因，对高产育种具有重要价值。为了明确野生二粒小麦GW2基因的遗传变异，挖掘其优异单倍型，本研究克隆了野生二粒小麦的GW2基因并进行了序列特征和基因结构等分析。结果显示，在野生二粒小麦中，GW2基因具有A和B两个同源拷贝，分别命名为TdGW2-A和TdGW2-B,两者均编码一个425 aa的蛋白序列，并具有一个Ring结构域。基于公共数据库的重测序数据分析发现，野生二粒小麦、栽培二粒小麦和硬粒小麦的GW2-A/GW2-B的π值分别为0.297 239/0.332 527、0.295 072/0.296 317和0.264 839/0.198 636,推测两个同源拷贝在四倍体小麦驯化过程中均发生了遗传瓶颈效应，其B拷贝受到的瓶颈效应更强。单倍型分析发现，TdGW2-A和TdGW2-B分别具有4种单倍型；栽培二粒小麦和硬粒小麦A拷贝具有5种单倍型，B拷贝只有3种单倍型；3种四倍体小麦的GW2-A和GW2-B主要单倍型占比分别为58%/63%、65%/83%和77%/67%,暗示驯化和人工选择趋向于主要单倍型。本研究克隆了野生二粒小麦粒重基因GW2并初步分析了其在四倍体小麦中的遗传分化和单倍型，为进一步挖掘野生二粒小麦粒重优异单倍型和功能性分子标记开发奠定了基础。
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不同基因型和预处理方式对大葱离体雌核发育诱导单倍体的影响
《山东农业科学 》 2020
摘要：以大葱未开放花蕾为试材,研究不同基因型和低温、热激两种预处理方式对大葱离体雌核发育诱导单倍体效果的影响.结果表明:不同基因型大葱以鲁葱杂5号的胚状体诱导率最高,为4. 50%,再生植株数为15株;低温处理的胚状体诱导率和再生植株数整体高于热激处理,两指标分别于低温处理3 d、热激处理36 h时达到最大值,分别为7. 50%、41株和3. 50%、17株;基因型和预处理试验分别得到31、147株再生植株,其中,分别有4、18株被鉴定为单倍体,单倍体诱导率分别为12. 90%和12. 24%.
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洋葱雄性不育分子标记在单倍体鉴定中的应用
《生物技术通报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：为有效鉴定和利用洋葱单倍体,以3个洋葱杂交种的未受精花蕾为外植体,通过离体雌核发育途径诱导产生再生植株.利用流式细胞仪对再生植株的倍性进行鉴定,利用DNF-566、RNS-357和AcSKP1标记对再生植株进行纯合性检测.结果表明,源于"阿盾"和"地球"的再生植株在Ms位点的基因型均为纯合的.源于"大宝"的16株再生植株中,有13株在Ms位点的基因型是纯合的,3株是杂合的.说明纯合植株是由大孢子母细胞发育而来,杂合植株可能是由子房壁或其他体细胞发育而来的二倍体.共获得7株二倍体,其中4株为双单倍体.获得的双单倍体,可进一步作为杂交种选育的亲本材料.洋葱Ms位点的分子标记可以作为一种有效的分子标记手段用于洋葱单倍体再生植株与供体杂交种亲本的同源性分析,与流式细胞仪结合起来可以快速准确鉴定双单倍体.
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大葱离体雌核发育诱导单倍体研究
《山东农业科学 》 2018
摘要：以大葱未开放花蕾为试材,研究花蕾大小、培养基、外源激素浓度配比不同对大葱离体雌核诱导单倍体的影响,旨在建立大葱离体雌核发育诱导单倍体技术体系。结果表明:直径为2. 0～2. 5 mm的未开放花蕾为最适外植体;在MS培养基中添加1. 0 mg·L-12,4-D和1. 5 mg·L-16-BA时,其雌核发育胚诱导率可达3. 5%;在B5培养基中添加1. 0 mg·L-12,4-D和1. 0 mg·L-16-BA时,其雌核发育胚诱导率可达2. 5%。将雌核发育胚转移至不含外源激素的1/2MS培养基中诱导生根,可发育成完整植株。通过根尖染色体计数分析,136株再生植株中有15株为单倍体,单倍率11%。由单倍体加倍获得的双单倍体是重要性状遗传分析、分子标记及数量性状研究的理想材料,此研究可为大葱遗传育种奠定基础。
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INCENP基因功能性单倍型可调控启动子活性并影响公牛精液品质
《遗传 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：为研究内着丝粒蛋白(Inner centromere protein,INCENP)基因启动子区单核苷酸多态性(SNPs)与精液品质的相关性,本文利用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测了250头中国荷斯坦公牛INCENP基因的基因型。在INCENP基因启动子区鉴定出两个SNPs(g.-556 G>T,rs 136823901和g.-692 C>T,rs 211010999),发现了3种单倍型(CG、TT、TG)。分析两个SNP位点的基因型频率和等位基因频率,各SNP及单倍型组合与中国荷斯坦公牛精液品质的相关性,结果表明SNP位点g.-556 G>T GT基因型个体的鲜精活力显著高于GG基因型个体(P<0.05),单倍型组合H1H1(CCGG)、H1H3(CTGT)、H2H3(TTGT)和H3H3(TTTT)个体的鲜精活力和冻精解冻后活力均显著高于H1H2个体(P<0.05)。为进一步研究g.-556 G>T和g.-692 C>T影响精液品质的可能机理,本文将3种单倍型质粒分别转染小鼠睾丸间质细胞(MLTC-1),结果显示含TG单倍型的载体荧光素酶活性最高。由此推测,g.-556 G>T和g.-692 C>T为启动子区功能性突变位点,可通过调节启动子活性来调控INCENP基因表达,进而影响精液品质。
关键词： INCENP SNP 单倍型 启动子区 精液品质 基因表达
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脂滴包被蛋白基因(PLIN)多态性与鸡胴体及脂肪性状的相关性
《农业生物技术学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：脂滴包被蛋白基因(perilipin,PLIN)对脂质代谢和脂肪沉积具有重要调控作用。为揭示PLIN基因多态性对鸡(Gallus gallus)胴体及脂肪性状的遗传效应,本研究以384只鲁禽B3系为研究材料,采用DNA测序和PCR-RFLP技术对PLIN进行多态性检测,在供试群体中检测到3个SNPs位点g.2272C>T、g.2319C>T和g.2467G>A。基于这3个SNPs位点,采用PHASE2.0软件构建了7个单倍型,其中C-C-G为最主要单倍型,频率高达71.94%;C-C-A和C-T-A单倍型频率最低,不足1%。基于7个单倍型构建了11个双倍型,H1H1频率最高,为52.60%;关联分析结果表明,双倍型对活体重、屠体重和腿肌重影响极显著(P<0.01),对腹脂重和腹脂率影响显著(P<0.05),对胸肌肌内脂肪含量有一定影响(P=0.094 9)。最小二乘分析结果表明,H1H3组合的活体重、屠体重、腿肌重、腹脂重和腹脂率最高,H4H6组次之,H6H6组合最低;H4H6组合胸肌肌内脂肪含量最高,H1H3组合最低。表明双倍型H6H6为劣势组合,在实际生产中应该去除,H4H6可以作为提高鲁禽鸡胴体性能和肉质风味的分子标记,在选育过程中应加强选择。本研究结果为PLIN基因应用于鸡分子育种提供了理论基础。
关键词： 鸡 脂滴包被蛋白基因(PLIN) 单倍型 屠宰性状 脂肪性状
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山东省二点委夜蛾不同地理种群遗传结构
《应用生态学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：二点委夜蛾是近年来在我国黄淮海夏玉米区暴发为害的一种玉米新害虫.为了系统揭示二点委夜蛾种群在山东省的扩散途径与发生规律,本研究利用线粒体细胞色素氧化酶亚基I(mtCOI)基因对山东省12个地市的二点委夜蛾种群以及威海1个二点委夜蛾形态近似种种群进行遗传结构分析.结果表明:130条二点委夜蛾mtCOI基因(608 bp)共有24个单倍型,7条二点委夜蛾形态近似种的mtCOI基因共有2个单倍型.单倍型网络图与系统发育树显示,威海地区二点委夜蛾形态近似种与其他种群分为2大组,它们之间存在着显著遗传分化,遗传距离为0.044~0.054.AMOVA分析表明,山东省二点委夜蛾种群遗传变异主要来自组间,该地区二点委夜蛾并没有经历过种群扩张.该研究为此害虫的预测预报及防治提供了科学依据.
关键词： 二点委夜蛾 线粒体COI 单倍型 地理种群 遗传分化
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离体雌核发育诱导洋葱单倍体与植株再生
《园艺学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：以来自日本的3个中日照型洋葱(Alliumcepa L.)杂交种的未开放花蕾为外植体材料,研究了2,4-D和6-BA浓度及配比对单倍体诱导培养的影响,以建立洋葱单倍体诱导技术体系。研究结果表明,含有1.5mg·L-12,4-D+1.5mg·L-16-BA和2.0mg·L-12,4-D+2.0mg·L-16-BA的B5培养基适于洋葱单倍体的诱导,诱导率最高达到4.00%。共获得了43枚雌核发育胚,雌核发育胚转移至不含激素的B5基本培养基中即可发育成完整植株,再生植株驯化移栽成活率达到100%。利用根尖染色体计数和流式细胞仪鉴定有42株是单倍体。
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鸡VLDLR基因多态性与蛋黄性状的关联分析
《畜牧兽医学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：本研究采用PCR-RFLP方法,检测VLDLR基因在山东地方鸡种汶上芦花鸡、济宁百日鸡和莱芜黑鸡中的多态性,并分析各多态位点不同基因型与4个蛋黄性状的相关性。结果表明,在3个供试群体中共检测到2个具有生物学意义的SNPs位点,即第6外显子8 467nt处的G→A突变(V8467)和第17内含子13 876nt处的A→G突变(V13876)。最小二乘分析结果表明,V8467对蛋黄质量有极显著影响(P<0.01),对蛋黄高度有显著影响(P<0.05);V13876对蛋黄质量有极显著影响(P<0.01),对蛋黄比率和蛋黄高度有显著影响(P<0.05);而双倍型对蛋黄质量、蛋黄比率的影响均达到极显著水平(P<0.01),对蛋黄高度的影响达到显著水平(P<0.05)。结果提示:本研究检测到的VLDLR基因的V8467和V13876多态性位点可以作为蛋黄性状的候选分子标记。
关键词： 鸡 VLDLR基因 蛋黄性状 SNPs 单倍型 PCR-RFLP
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