科研产出
利用SRAP标记构建山东省苹果资源指纹图谱
《沈阳农业大学学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：构建山东省苹果属植物资源指纹图谱,为该地区资源保护、利用及创新奠定基础.以山东省内59份苹果属植物资源为试材,采用改良CTAB法提取基因组DNA,从15条正向引物和16条反向引物随机组合的240对SRAP引物中筛选出25对条带清晰、多态性高的引物组合用于试验.根据电泳胶图,计算多态性引物的总扩增条带数、多态性条带数和多态性条带比率.按照Botstein公式计算多态信息含量;用POPGENE32软件计算观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)、Shannon's信息指数(I),并进行遗传多样性分析.用NTSYS-pc2.10e软件UPGMA方法进行聚类分析,并计算遗传相似性系数.采用引物对组合的方法,构建59份山东苹果资源数字指纹图谱.共检测出176个条带,其中多态性谱带158条,多态性比率达89.77%,平均每对引物组合产生7.04个条带和6.31个多态性条带.样品间平均观察等位基因数、有效等位基因数、Nei's基因多样性指数及Shannon's信息指数分别为1.8898,1.4945,0.2861及0.4302.UPGMA聚类结果表明,59份样品间的相似性系数为0.6540~0.9829,平均为0.7060.用SRAP多种引物组合方法有效区分59份苹果种质资源,并建立指纹图谱,置信概率达99.99%.选取遗传相似系数0.7010进行分类,59份供试苹果材料可以分为3大类群.第Ⅰ类群为原产山东的野生资源泰山海棠(Malushupehensis var. taishanensis),第Ⅱ类群以海棠(M.micromalus)和楸子(M.prunifolia)为主,含有少量的小果型花红,第Ⅲ类群主要以苹果(M.domestica)、花红(M.asiatica)为主,含有少量的海棠(M.micromalus)和楸子(M.prunifolia).当遗传相似系数为0.7480时,第Ⅱ类群、第Ⅲ类群又分别可以划分出若干小的类群,苹果(M.domestica)聚在一起,中国绵苹果(M.domesticasubsp.chinesis)、大部分的花红(M.asiatica)聚在一起,大部分的海棠(M.micromalus)与楸子(M.prunifolia)交互聚在一起,聚类结果总体上与形态学分类标准相一致.
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26个草菇菌株SRAP分析
《中国农学通报 》 2019
摘要：为充分利用和保护草菇种质资源,笔者利用SRAP-PCR技术对来源于不同地区的26个草菇菌株进行遗传多样性分析,采用改进的SDS法提取DNA。由9条正向引物和17条反向引物组成153对引物中,筛选出11对多态性引物,共扩增出148个位点,其中多态性位点142个,片段大小在0.11～2.51 kb之间,扩增位点多态性比率在75.0%～100%之间,多态性比率为95.5%。利用NTSYS-PC2.1e软件对26个草菇品种进行聚类分析,标记在相似系数0.76时,26个草菇菌株可划分为3个类群。其中,天达V971、高邮草V112、单生草菇等19个菌株聚为一类;聚为第二类的6个菌株包含绵草V23、习酒草V11、绵草931、习酒V23、高邮V11、土草V23;而银丝草菇自成一类。说明草菇存在相互引种后又重新保藏命名的现象,同时草菇在一定程度上出现了地域基因分化。探究草菇分子基因库,为山东省草菇种质资源库的建立、草菇育种和遗传改良提供了基础数据。
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利用SRAP标记构建甘薯分子连锁图谱
《作物学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：以高淀粉甘薯品种漯徐薯8号为母本,低淀粉甘薯品种郑薯20为父本,杂交得到的F1分离群体的240个单株为作图群体,利用SRAP标记技术,共得到770个母本的多态性标记和523个父本的多态性标记,用JoinMap3.0软件和"双假测交"策略,分别构建了2个亲本的分子连锁图谱。其中漯徐薯8号的图谱包括由473个SRAP标记组成的81个连锁群,总图距为5802.46cM,标记间平均图距为10.16cM;郑薯20的图谱包括由328个SRAP标记组成的66个连锁群,总图距为3967.90cM,标记间平均图距为12.02cM。该高密度分子连锁图谱的构建,为甘薯分子标记辅助选择、基因定位及克隆研究奠定了基础。
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卫星搭载处理丹参种子SP_2代的SRAP分析
《核农学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：为探讨航天搭载丹参种子的诱变效应,本研究调查了航天搭载处理对SP2代材料植株地上、地下部各性状的影响,并利用SRAP技术分析其生物学水平上的差异。结果表明:丹参种子SP2代的航天诱变效果明显,不同植株不同性状所表现出的效应不一致。利用12对引物对丹参航天材料进行分析,共产生146条多态性条带,丹参航天材料之间的遗传相似系数在0.453～0.867之间,平均为0.648。
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