GenBank中花生栽培种基因组DNA及EST序列的SNP分析

唐月异; 张建成; 王秀贞; 崔凤高; 王传堂; 《花生学报 》 2010

摘要：下载GenBank数据库中已公布的花生栽培种基因组DNA序列1718条及EST序列85797条,利用DNAStar软件进行叠连群构建,基因组DNA序列构建叠连群161个,长度共计152940bp,直接鉴定出候选SNP位点5496个,SNP平均出现频率为3.59%;EST序列构建10990个叠连群,长度共计10477241bp,由三条及三条序列以上构成的叠连群的总长度为6524329bp,发现候选SNP位点307179个,SNP平均出现频率为4.71%。

关键词： 花生 SNP 频率 GenBank