科研产出
克拉玛依地区某奶牛场犊牛肺炎病原检测、分离鉴定及药敏试验
《中国奶牛 》 2024
摘要：为确定新疆克拉玛依地区某奶牛场犊牛肺炎的发病病因并提供合适的治疗方案和防控措施,采集该牛场12头患肺炎犊牛的鼻腔黏液,进行了牛呼吸道疾病相关病原检测、分离培养、形态学观察、生化试验、16S rRNA基因测序和药物敏感性试验.结果显示,犊牛肺炎主要是以牛支原体为主的混合感染发病,从病料中分离得到的菌落呈现典型的"煎蛋样",经过生化鉴定和16S rRNA测序分析,分离得到1株牛支原体,将其命名M.bovis KLMY株.通过药敏试验从13种药物里选择出恩诺沙星对M.bovis KLMY株最为敏感.通过以上研究表明,造成此次犊牛肺炎的主要病原为牛支原体,且耐药现象严重,本试验结果为该牛场进一步治疗犊牛肺炎提供了合理有效的依据.
关键词： 犊牛肺炎 牛支原体 混合感染 药敏试验 16S rRNA
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一株鸭源多杀性巴氏杆菌的分离鉴定及耐药性分析
《家禽科学 》 2024
摘要：为确认山东省德州市某肉鸭场疑似为鸭多杀性巴氏杆菌感染的病原菌，本试验对于送检病死鸭进行剖检、细菌分离培养、菌落观察、生化试验、PCR鉴定、16Sr RNA基因测序分析以及药敏试验等方法鉴定该病原菌。结果显示：分离得到的病原菌在含有5%胎牛血清的营养琼脂培养基中呈现为圆形、湿润、光滑的灰白色菌落，革兰氏染色为阴性短杆菌，瑞氏染色呈现两极浓染；分离菌株的生化特性可以发酵葡萄糖、蔗糖以及甘露醇，硫化氢、氧化酶等试验阳性；细菌特异性PCR扩增片段与预期条带大小一致；16S rRNA基因序列系统进化树显示与多杀性巴氏杆菌同源性为99%；分离菌株对于新霉素、阿莫西林、氨苄西林、头孢噻肟、林可霉素具有耐药性，对于氟苯尼考、恩诺沙星、多西环素、粘杆菌素B、卡那霉素、大观霉素敏感。本研究结果为鸭源多杀性巴氏杆菌病的防治提供一定参考依据。
关键词： 鸭 多杀性巴氏杆菌 分离鉴定 16S rRNA 耐药性
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施氮水平对花生根际土壤微生物群落结构和多样性的影响
《山东农业科学 》 2023 北大核心
摘要：本试验通过16S rRNA基因测序技术，研究零氮（0 kg/hm~2）、低氮（75 kg/hm~2）、中氮（150 kg/hm~2）和高氮（225 kg/hm~2）4个氮肥梯度对花生根际土壤微生物群落组成和结构的影响。结果表明，施氮可以提高花生根际土壤微生物群落的丰富度和多样性，不同氮肥处理中以中氮处理的Chao 1指数和Shannon指数最高。施氮处理下的OTUs个数均多于不施氮，且随着氮肥施入量的增加呈先升高后降低的趋势，中氮处理较零氮、低氮和高氮分别高11.21%、4.90%和7.01%。不施氮和在一定施氮范围内，土壤微生物群落稳定，但是高氮会导致土壤微生物群落不稳定。16S rRNA功能预测分析显示，施氮处理下的细胞运动等功能基因的丰度相对升高，对花生根际土壤微生物群落的功能丰度谱产生一定的影响。本研究明确了施氮对花生根际土壤微生物群落结构和多样性的影响，为深入研究不同施肥措施对花生根际微生态的影响提供了借鉴。
关键词： 花生根际 施氮水平 土壤微生物群落功能多样性 16S rRNA
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有机肥和钙肥对盐碱土花生根际细菌群落结构的影响
《中国农业科技导报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为研究有机肥和钙肥对盐碱地花生根际微生物群落结构和功能的影响,以不施肥为对照(CK)、设置施用钙肥(C)、有机肥(M)和有机肥+钙肥(CM)处理,通过构建细菌16S rRNA基因文库和高通量测序技术对不同处理下花生根际微生物进行测序.结果表明,施用有机肥、钙肥和有机肥钙肥配施均显著影响较轻度盐碱土壤花生根际微生物的多样性和丰富度,而对较重度盐碱土花生根际细菌的多样性和丰富度无显著影响.PCoA分析表明,样本OTUs多样性与土壤盐碱程度关系密切,施用钙肥处理花生根际微生物的菌群结构与其他处理间存在较大差异.两种滨海盐碱土花生根际微生物的种群结构均受施用有机肥、钙肥及其配施的影响,不同处理根际微生物均具有相同的优势菌群,但各优势菌群的相对丰度存在较大差异.在目和科水平上,有占总细菌76.3%~82.5%的新种OTUs未能注释,说明黄河三角洲滨海盐碱土花生根际蕴含大量微生物新种资源.16S rRNA功能预测分析表明,施用钙肥和有机肥处理均可显著提高2种土壤花生根际微生物碳水化合物代谢、氨基酸代谢、能量代谢、辅助因子和维生素的代谢、核苷酸代谢、翻译和膜运输等相关功能基因丰度.由此可见,施用钙肥和有机肥有利于改良盐碱土壤根际微生态环境,提高植物胁迫耐受性.
关键词： 盐碱土 花生根际 微生物菌群多样性 有机肥 钙肥 16S rRNA
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土壤类型对花生根际土壤细菌群落多样性和产量的影响
《生物技术通报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为了解不同土壤类型花生根际土壤细菌菌群多样性差异与产量的关系,明确不同土壤类型花生生产特性的区域优势,以6个花生主产区代表性土壤为研究对象,采用盆栽实验利用高通量测序技术研究不同土类花生根际土与非根际土细菌群落结构和变化特征.对6个土壤样品细菌菌群丰富度和多样性分析显示,湖南邵阳红壤细菌丰富度和多样性均较低,河北滦县褐土细菌丰富度和多样性均较高.放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、酸杆菌门(Acidobacteria)及芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)等为共有优势菌门,但在不同土壤类型样本中的菌群丰度存在明显差异,其中湖南邵阳红壤中绿弯菌门优势最明显,其他土壤类型放线菌门和变形菌门优势较明显.根际土与非根际土细菌门丰度间有差异,湖南邵阳红壤根际土与非根际土各细菌门(包括放线菌门、变形菌门、绿弯菌门、酸杆菌门、芽单胞菌门以及厚壁菌门)丰度变化程度较其它地区大.冗余分析表明,土壤酸碱度(pH)、有机质(ORM)、碱解氮(N),速效磷(P)和速效钾(K)等土壤理化因子对细菌菌群组成和物种丰度均有影响,但影响程度和正负相关性因土壤类型而异,河南焦作潮褐土细菌菌群与所有土壤理化因子均为锐角,呈显著正相关;而湖南邵阳红壤细菌菌群与所有因子间均为钝角,呈显著负相关.统计学分析显示,吉林公主岭黑土、新疆石河子棕钙土和山东沂南褐土荚果产量较高,湖南邵阳红壤荚果产量较低.优势菌门变形菌门在吉林公主岭黑土、新疆石河子棕钙土和山东沂南褐土中相对丰度高于湖南邵阳红壤,属水平鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)相对丰度在山东沂南褐土和吉林公主岭黑土也较高,推测变形菌门和鞘氨醇单胞菌属在花生生长发育和荚果产量提高方面是有利的.不同土壤类型花生根际细菌组成虽有一定的相似性,但差异性明显,个别菌群丰度呈现出特有性,其中变形菌门和鞘氨醇单胞菌属可能分别是与花生荚果产量提高相关的有益菌门和菌属.湖南邵阳红壤花生荚果产量最低,其花生生产的土壤禀赋优势较低.
关键词： 花生 根际 花生主产区 土壤类型 细菌菌群多样性 16S rRNA
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盐胁迫下配施钙肥对花生根际土壤细菌群落结构的影响
《干旱地区农业研究 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为了解不同生育时期盐胁迫下基施钙肥花生根际土壤微生物群落结构变化,以期通过改良盐碱土壤根际微生物环境来提高植物胁迫耐受性.采用盆栽试验设置不同盐胁迫强度及基施钙肥处理,以花生不同生育时期根际土壤为研究对象,通过构建细菌16S rRNA基因文库和高通量测序技术进行测序,并对测序结果进行生物信息学分析.结果表明:各处理土壤样本细菌物种多样性高且分布均匀,盐胁迫可提高花生根际微生物群落相对丰富度和多样性,并与生育时期有关;盐胁迫、生育时期和外源施钙各处理样本的优势菌纲、优势菌科及优势菌种相同,其优势菌纲均为放线菌纲(Actinobacteria)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、γ-变形杆菌纲(Gammaproteobacteria)、疣微菌纲(Verrucomicrobiae)、Saccharimonadia、芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes)、拟杆菌纲(Bacteroidia)和酸杆菌纲(Ac-idobacteriia)等8种,优势菌科有norank_o__Saccharimonadales、鞘脂单胞菌科(Sphingo monadaceae)、芽单胞菌科(Gemmatimona daceae)、伯克氏菌科(Burkhold eriaceae)和norank_o__Gaiellales菌科等;盐胁迫和基施钙肥处理均能显著提高γ-变形杆菌纲(Gammaproteobacteria)和疣微菌纲(Verrucomicrobiae)丰度,并随生育时期的延长和盐胁迫强度增大更为明显,高盐胁迫下花针期和收获期两菌纲丰度分别是其对照的1.2、1.8倍和1.6、1.5倍,但盐胁迫下基施钙肥处理可使放线菌纲(Actinobacteria)、Saccharimonadia菌纲相对丰度明显降低,并随盐胁迫强度提高相对丰度降幅明显,且开花下针期降幅较大;噬几丁质菌科(Chitinophagaceae)和丰佑菌科(Opitutaceae)的相对丰度受盐胁迫强度和生长阶段影响显著,并随盐胁迫强度升高而显著提高;生长盛期和基施钙肥处理的氨基酸代谢、能量代谢、辅助因子和维生素的代谢和核苷酸代谢等功能基因相对丰度显著提高;盐胁迫严重抑制花生籽仁发育,产量明显降低,高盐胁迫使荚果产量降低40%~50%.
关键词： 花生 盐胁迫 根际土壤 土壤微生物群落 16S rRNA
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花生根际微生物群落结构对干旱和盐胁迫的响应
《花生学报 》 2021
摘要：为探究水盐共同作用下花生根际土壤微生物的响应,从花生根际细菌群落结构的角度阐述干旱和盐胁迫对花生根际细菌菌群多样性的影响及与根际微生物间的相互作用。采用盆栽试验,设计对照、盐胁迫、中度干旱胁迫和旱盐同时胁迫四个处理,通过16S rRNA基因测序技术,研究花生饱果期根际土壤细菌群落结构和变化情况。结果表明:干旱胁迫、盐胁迫及二者同时胁迫处理的优势菌门均为变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、酸杆菌门（Acidobacteria）、绿弯菌门（Chloroflexi）和拟杆菌门（Gemmatimonadota）。干旱胁迫和盐胁迫均使得变形菌门和酸杆菌门相对丰度降低,而蓝藻菌门（Cyanobacteria）的相对丰度提高,但在干旱和盐同时胁迫条件下蓝藻菌门的相对丰度降幅达60.0%。本试验为特异功能物种和菌株的分离提供了更大的可能和空间,为促生菌的分离培养优化和应用提供了技术基础和前景。非生物胁迫影响根际土壤微域环境,对花生根际土壤细菌群落结构具有调控作用。调节微生物群落结构,改良土壤微域环境,是提高植物胁迫耐受性的有效途径。
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干旱与盐胁迫对花生根际土壤细菌群落结构和花生产量的影响
《应用生态学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：以花生品种花育25号为试验材料,采用盆栽试验研究了开花期干旱和盐分胁迫对花生生长发育和荚果产量的影响,并运用高通量测序技术分析干旱、盐胁迫及旱盐双重胁迫下,花生根际土壤细菌群落结构的变化特征.结果表明:不同胁迫处理花生根际土壤细菌群落均以变形菌门、放线菌门、Saccharibacteria、绿弯菌门、蓝藻菌门和酸杆菌门为主.干旱、盐胁迫及旱盐双重胁迫均不同程度降低了变形菌门和放线菌门的相对丰度,但显著提高了蓝藻菌门的含量,且旱盐双重胁迫较其单一胁迫引起的根际蓝藻菌门丰度变化更显著.土壤细菌功能预测分析显示,信号转导机制、防御机制及翻译后修饰、蛋白质周转和分子伴侣等相关功能在旱盐双重胁迫的细菌中活性更强,可能对花生生长及胁迫应答具有重要影响.统计学分析显示,开花期干旱、盐胁迫和旱盐双重胁迫严重影响花生生长发育,并显著降低产量.研究结果可为通过改良土壤微生物环境来提高植物胁迫耐受性提供参考.
关键词： 花生 根际 旱盐胁迫 细菌群落结构 16S rRNA
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花生根际土壤细菌群落对干旱和盐胁迫的响应
《中国油料作物学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为明确旱、盐及旱盐双重胁迫对花生根际土壤细菌群落的影响,采用盆栽试验,通过16S rRNA基因测序技术,研究了花生开花期干旱、盐胁迫及旱盐双重胁迫下花生根际土壤细菌群落结构的变化.结果表明,花生根际土壤细菌群落均以放线菌纲(Actinobacteria)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、未分类菌目(norank_p__Saccharib-acteria)、蓝藻纲(Cyanobacteria)、酸杆菌纲(Acidobacteria)、芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes)和β-变形菌纲(Betapro-teobacteria)7个优势菌纲为主.干旱和盐胁迫处理均不同程度提高了α-变形菌纲和蓝藻纲的含量,且对蓝藻纲的诱导效果较显著,推测蓝藻纲在提高花生胁迫耐受性方面具有重要功能.非生物胁迫影响根际土壤微域环境,对花生根际土壤细菌群落结构具有调控作用.调节微生物群落结构,改良土壤微域环境,是提高植物胁迫耐受性的有效途径.
关键词： 花生根际 旱盐双重胁迫 细菌群落多样性 16S rRNA
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发菜基因组DNA提取方法比较与分子鉴定研究
《药学研究 》 2018
摘要：目的以发菜为研究对象比较不同的提取DNA方法,筛选出了一种适合快速提取发菜DNA的方法。方法分别利用自主研发的硅珠DNA纯化技术、细菌试DNA提取试剂盒和植物DNA提取试剂盒提取发菜基因组DNA。结果本实验室开发的硅珠DNA提取纯化技术具有快速、无毒以及获得的发菜DNA纯度高等优势。通过聚合酶链式反应(PCR)扩增和测序得到16S rRNA基因,利用Blast软件进行序列比对,与发菜同源性为99%。结论本研究研制的发菜基因组DNA提取方法可用于发菜源性的分子鉴定。
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