科研产出
黑素皮质素受体4(MC4R)基因在5个地方鸡种中的遗传多态性分析
《山东农业科学 》 2017
摘要:本试验采用PCR-SSCP和PCR-RFLP方法分析了黑素皮质素受体4(MC4R)基因在5个地方鸡种中的遗传多态性,结果在5个供试鸡群体中检测到两个突变位点。在NC_006089.4:g.54 C>G位点中,CC基因型在莱芜黑鸡和琅琊鸡中均没有检测到,CG杂合型在汶上芦花鸡中表现为优势基因型,突变型GG基因型在其余4个群体中表现为优势基因型,等位基因G在所有供试群体中表现为优势等位基因。在NC_006089.4:g.315位点中,GT杂合型在汶上芦花鸡中表现为优势基因型,GG野生型在其余4个群体中表现为优势基因型,等位基因G在除汶上芦花鸡以外的4个群体中表现为优势等位基因。
关键词: 鸡 MC4R基因 PCR-SSCP PCR-RFLP 遗传多态性
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三个牛品种MBL1基因第一内含子与第二外显子遗传多态性研究
《中国农业科技导报 》 2010
摘要:采用巢式PCR、DNA测序和CRS-PCR方法,研究中国荷斯坦牛、鲁西黄牛、渤海黑牛的MBL1基因内含子1和外显子2的单核苷酸多态性(SNPs),发现了855(G/A)、2651(G/A)和2686(T/C)3个新SNP位点。855(G/A)位于内含子1上,2651(G/A)导致Val24 Ile氨基酸的改变,2686(T/C)为同义突变。3个SNP位点在3个牛品种群体中优势等位基因相同,分别为G、G、C,其等位基因频率分别为0.87/0.58/0.57、1/0.75/0.74、1/0.76/0.63。经χ2适合性检验,荷斯坦牛在855(G/A)位点、鲁西黄牛在855(G/A)、2651(G/A)位点、渤海黑牛的所有位点达到Hardy-W e inberg平衡状态(P>0.05)。3个牛品种在855(G/A)位点均表现为低度多态;在2651(G/A)和2686(T/C)位点均表现为中度多态(0.25
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中国荷斯坦牛CXCR1基因编码区的遗传多态性
《西北农林科技大学学报(自然科学版) 》 2009 北大核心 CSCD
摘要:【目的】研究中国荷斯坦牛趋化因子受体1基因(Chemokine(C-X-C motif)receptor1,CXCR1)编码区的遗传多态性。【方法】采用巢式PCR、DNA测序和创造酶切位点法,对中国荷斯坦牛CXCR1基因编码区下游区域的单核苷酸多态位点(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)进行筛查,并对筛查到的SNPs进行群体遗传多态性分析。【结果】发现了819(A/G)、995(A/G)和1008(C/T)3个SNPs,其中995(A/G)和1008(C/T)为首次报道的多态位点,995(A/G)位点导致第332位的Arg突变为His。CXCR1基因819(A/G)、995(A/G)和1008(C/T)3个位点在中国荷斯坦牛群体的优势等位基因分别为G、G和C,其等位基因频率分别为0.634 0,0.733 0和0.706 4。经χ2适合性检验,荷斯坦牛在3个位点均未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05);3个位点均表现为中度多态。【结论】中国荷斯坦牛CXCR1基因编码区的遗传多态性比较丰富。
关键词: 中国荷斯坦牛 CXCR1基因 遗传多态性 优势等位基因
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荷斯坦牛Nramp1基因遗传多态性及其与乳房炎相关性的研究
《遗传 》 2009 北大核心 CSCD
摘要:利用PCR-SSCP技术检测了344头中国荷斯坦牛Nramp1基因exon 11的基因多态性,并分析了其不同基因型与乳房炎及产奶量性状的关系。结果表明:实验群体发现3种基因型AA、AB、BB,其中A等位基因为优势等位基因,等位基因频率为0.767,而B等位基因频率则为0.233。经X~2适合性检验,群体处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。测序结果显示:扩增片段分别在200 bp(C/G)和254 bp(T/G)存在碱基突变,并导致了氨基酸改变,分别为丙氨酸替换为脯氨酸(A1a356Pro)、亮氨基酸替换为蛋氨酸(Leu374Met)。通过构建最小二乘线性模型,进行Nramp1基因多态性与产奶量、体细胞评分(SCS)的相关性分析表明,AA型个体的SCS最小二乘均值显著低于BB、AB型(P<0.05),而AA型、AB个体的产奶量最小二乘均值显著高于BB型(P<0.01,P<0.05),AA基因型可作为乳房炎抗性的优良基因型。因此,可将Nramp1作为奶牛乳房炎候选基因应用于分子标记辅助选择育种。
关键词: Nramp1 遗传多态性 PCR-SSCP 乳房炎 中国荷斯坦牛
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牛糖基化依赖细胞黏附分子1基因(GlyCAM1)的遗传多态性分析
《农业生物技术学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要:以中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛为研究材料,利用CRS-PCR、PCR-SSCP及DNA测序技术检测了糖基化依赖细胞黏附分子1基因(GlyCAM1)的遗传多态性。结果表明,在牛GlyCAM1基因外显子3的第2081(A/C)和内含子3的2417(C/T)位点存在突变,两位点在3个牛群中的等位基因频率A/B分别为0.7525/0.2475、0.6112/0.3888和0.3375/0.6625;0.9046/0.0954、0.8383/0.1617和0.7875/0.2125;经χ2适合性检验,3个牛群在内含子3的突变达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),在外显子3鲁西黄牛和渤海黑牛达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),中国荷斯坦牛的突变在此位点未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。
关键词: 牛 糖基化依赖细胞粘附分子1基因(GlyCAM1) 遗传多态性 CRS-PCR PCR-SSCP
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中国荷斯坦牛GlyCAM1基因遗传多态性的研究
《黑龙江畜牧兽医 》 2009 北大核心
摘要:以273头中国荷斯坦牛为研究对象,利用CRS-PCR、PCR-SSCP及DNA测序技术检测了GlyCAM1基因外显子3、内含子3的遗传多态性。结果表明:GlyCAM1基因分别在外显子3和内含子3的第2 081(A/C)、2 417(C/T)位存在突变,2个位点的等位基因频率A/B分别为0.752 5,0.247 5和0.904 6,0.095 4;经x2适合性检验,中国荷斯坦牛内含子3的突变达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),但其外显子3的突变未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。
关键词: 中国荷斯坦牛 糖基化依赖细胞黏附分子1 基因 遗传多态性 CRS-PCR PCR-SSCP
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奶牛乳铁蛋白基因5′侧翼区遗传多态性及其与乳腺炎关联性分析
《遗传 》 2009 北大核心 CSCD
摘要:牛乳铁蛋白(Lactoferrin,LF)是保护乳腺组织的防御因子之一,是具有多种功能的糖蛋白。关于牛LF基因的多态性研究的报道较多,但其多态性与奶牛乳腺炎相关性的研究较少。文章采用PCR-RFLP、CRS-PCR对268头中国荷斯坦牛LF基因启动子区的-926(G/A)、-915(T/G)、-478(/G)、+72(T/C)突变进行基因型分型,应用最小二乘线性模型分析LF基因多态性与体细胞评分(Somaticcellscore,SCS)的相关性。结果表明,新发现+72(T/C)和-478(/G)对SCS有显著影响,而其他两个位点对SCS影响不显著(P>0.05)。+72(T/C)的AB基因型是优良基因型,其个体的SCS值均显著低于AA型(P<0.01)、BB型个体(P<0.05)。-478(/G)位点的C等位基因是优良的等位基因,CC基因型个体的SCS值极显著低于CD、DD基因型个体(P<0.01)。因此,LF基因+72(T/C)的AB基因型和-478(/G)位点的CC基因型均是奶牛乳腺炎抗性的优良基因型,可作为分子标记应用于奶牛乳腺炎抗性筛选。
关键词: 乳铁蛋白基因5′侧翼区 遗传多态性 乳腺炎 体细胞评分 中国荷斯坦牛
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中国荷斯坦牛GlyCAM1基因遗传多态性与乳房炎关联性分析
《中国农业科技导报 》 2008
摘要:以273头中国荷斯坦牛为研究对象,利用CRS-PCR、PCR-SSCP及DNA测序技术检测糖基化依赖细胞粘附分子1(GlyCAM1)基因外显子3、内含子3的遗传多态性。结果表明:GlyCAM1基因分别在外显子3和内含子3的第2081(A/C)、2417(C/T)位存在突变,两位点在牛群中的等位基因频率A/B分别为0.752 5/0.2475,0.904 6/0.095 4;经χ2适合性检验,中国荷斯坦牛群2417位点的突变达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),但2081位点的突变未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。采用最小二乘法拟合线性模型将该基因座不同基因型与奶牛乳房炎进行了关联分析,结果表明:胎次效应(P<0.01)、场效应(P<0.01)和泌乳月(P<0.05)对乳房炎的影响较大。2081位基因型效应对SCS的影响达到了显著水平(P<0.05),且AA基因型个体的SCS显著低于AB和BB基因型个体(P<0.05)。
关键词: 中国荷斯坦牛 糖基化依赖细胞粘附分子1基因 遗传多态性 SCS 乳房炎
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κ-酪蛋白基因及其功能研究进展
《中国畜牧兽医 》 2008 北大核心
摘要:κ-酪蛋白(kappa-casein,-κCN)是牛乳中的一种重要的蛋白质。作者简要介绍了κ-酪蛋白基因的结构、遗传多态性与产奶性状的关系及其编码蛋白质的生物学功能等方面的研究进展。
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