科研产出
野生花生全基因组抗病相关LOX基因的生物信息学分析
《山东农业科学 》 2015
摘要:脂肪氧合酶(lipoxygenases,LOX)是生物体内一种重要的双加氧酶,其在植物发育以及响应生物和非生物胁迫时发挥重要作用。本研究从Arachis duranensis和Arachis ipaёnsis两个野生花生基因组中各鉴定出18个LOX基因,分别命名为Ad LOX1~18和Ai LOX1~18。在Ad LOX5、Ad LOX7、Ai LOX8和Ai LOX18基因的CDS序列中发现提前终止翻译的终止密码子,而Ai LOX9基因的CDS序列过短,推测这些基因可能是假基因。染色体定位结果显示,Ad LOX和Ai LOX基因主要分布在2、3、6、8、9和10号染色体上,且其直系同源基因分布在两套染色体相同或相近的位置。通过分析Ad LOX和Ai LOX基因与已知功能LOX基因的亲缘关系发现,AdLOX6、Ad LOX9、Ad LOX11、Ad LOX12、Ad LOX17、Ai LOX1、Ai LOX4、Ai LOX6、Ai LOX16和Ai LOX17基因可能参与花生的抗病过程,启动子分析结果也支持这一结论。基因选择压力研究表明,Ad LOX和Ai LOX基因在进化历程中受到纯化选择。
关键词: 野生花生 LOX基因家族 抗病 系统发育 选择压力
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花生HIR基因的克隆表达与进化分析
《山东农业科学 》 2014
摘要:过敏性反应是植物抗病机制中最常见的形式之一。过敏性诱导反应(Hypersensitive-induced reaction)基因HIR是与过敏反应相关的一类基因,属于PID家族成员,参与许多细胞生理过程,并与细胞程序化死亡有密切关系。本研究从花生转录组文库中筛选到编码HIR基因的部分序列,通过5'-RACE获得花生HIR基因的全长cDNA序列,并克隆了其基因组序列。分析表明,花生HIR基因与其他物种HIR基因具有高度同源性。对6个物种共17条HIR序列使用最大似然法进行进化分析表明,该基因在进化中受到了强烈的纯化选择作用。qRT-PCR分析发现,该基因的表达量在冷处理4 h时显著降低,随着处理时间延长其表达量逐渐回升;在病菌处理的材料中该基因的表达下调。这些结果为进一步研究HIR基因在花生抗病、耐逆中的功能奠定了基础。
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抗病大白菜新品种‘天正秋白一号’
《园艺学报 》 2001 北大核心 CSCD
摘要:‘天正秋白一号’是以‘安阳二包头’经多代自交选择育成的优良自交不亲和系安 10 4 3为父本 ,以‘福山二包头’通过抗性转育、筛选的自交不亲和系新福 10 4 2为母本配制成的大白菜一代杂种。该品种生长期 80d ,中晚熟 ;球叶叠抱 ,叶球矮桩倒锥形 ;叶色淡绿 ,白帮 ,净菜率 75 % ,单球质量 5 .1kg ;高抗病毒病、兼抗霜霉病和软腐病。
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