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野生花生全基因组抗病相关LOX基因的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 宋辉 1 ; 赵术珍 1 ; 侯蕾 1 ; 乔善良 2 ; 赵传志 1 ; 李爱芹 1 ; 王兴军 1 ;

作者机构： 1.山东省农业科学院生物技术研究中心

2.鱼台县林业局

关键词： 野生花生;LOX基因家族;抗病;系统发育;选择压力

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2015 年 10 期

页码： 1-7

摘要： 脂肪氧合酶(lipoxygenases,LOX)是生物体内一种重要的双加氧酶,其在植物发育以及响应生物和非生物胁迫时发挥重要作用。本研究从Arachis duranensis和Arachis ipaёnsis两个野生花生基因组中各鉴定出18个LOX基因,分别命名为Ad LOX1~18和Ai LOX1~18。在Ad LOX5、Ad LOX7、Ai LOX8和Ai LOX18基因的CDS序列中发现提前终止翻译的终止密码子,而Ai LOX9基因的CDS序列过短,推测这些基因可能是假基因。染色体定位结果显示,Ad LOX和Ai LOX基因主要分布在2、3、6、8、9和10号染色体上,且其直系同源基因分布在两套染色体相同或相近的位置。通过分析Ad LOX和Ai LOX基因与已知功能LOX基因的亲缘关系发现,AdLOX6、Ad LOX9、Ad LOX11、Ad LOX12、Ad LOX17、Ai LOX1、Ai LOX4、Ai LOX6、Ai LOX16和Ai LOX17基因可能参与花生的抗病过程,启动子分析结果也支持这一结论。基因选择压力研究表明,Ad LOX和Ai LOX基因在进化历程中受到纯化选择。

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