科研产出
大白菜EST-SSR反应体系优化及引物筛选
《科技导报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：探讨了大白菜EST-SSR反应体系的优化,利用优化的体系筛选部分引物。采用L16(44)正交设计,研究各主要参数的适宜浓度,建立适合大白菜EST-SSR反应的最佳体系。结果表明,各因素不同水平浓度对扩增结果均有一定影响,其中以引物浓度影响最大,其次是dNTP和Taq DNA聚合酶,最小是模板DNA用量。优化后的最佳体系(20μL)为:引物浓度1.0μmol/L,dNTPs0.25mmol/L,Taq酶0.5U,模板DNA70ng。利用优化的体系,根据大白菜EST序列设计引物126对,分别以2对抗、感病毒病的大白菜材料的基因组DNA为模板进行扩增,筛选出至少在一份材料中扩出多态性的引物19对。该优化体系可用于大白菜EST-SSR扩增,初步筛选的引物可用于大白菜病毒病分子标记的进一步研究。
关键词： 大白菜 EST-SSR 正交设计 体系优化 引物筛选
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核桃RAPD引物筛选及品种间亲缘关系研究
《中国农学通报 》 2010 北大核心
摘要：以30个核桃品种为试验材料,首次建立了11 nt引物长度的优化核桃RAPD技术体系。从40个11 bp碱基中共筛选出适用于核桃遗传多样性分析18个11 nt引物。这些引物在30个核桃品种中共扩增出111个DNA片段,片段大小在500~3050之间,其中77个DNA片段表现出多态性,占总扩增片段的69.4%。根据RAPD指纹信息对核桃品种资源的遗传距离进行了分析,并据此构建了聚类树状图。从聚类结果看,30个核桃品种可以划分成遗传差异较明显的10组。
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