科研产出
花生油脂合成相关基因的表达谱分析
《作物学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为研究不同发育时期花生籽仁油脂合成过程中基因表达调控模式,本研究以高油酸、中油花生品系F18和低油酸、低油花生品种‘鲁花6号’为材料,对下针后10、30、40、60 DAP （days after pegging）的花生种子进行表达谱芯片测序。结果表明, 130、3556、2783个基因分别在30、40、60 DAP时期差异表达。GO注释和KEGG富集结果显示,差异表达的基因主要富集在脂肪酸合成和光合等代谢进程中,其中FAB2、FAD2、WRI1等主要参与油酸的积累,参与光合作用的基因均为捕光叶绿素a/b结合蛋白,全部上调表达。代谢通路图结果表明,籽仁发育的40DAP和60 DAP时期,脂肪酸合成途径的基因均上调表达。研究结果为花生油脂代谢的分子机制提供理论基础,同时也为花生品质改良贡献了基因资源。
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基因芯片技术在动物医学中的应用前景分析
《家畜生态学报 》 2016 北大核心
摘要：基因芯片技术做为全新的微量分析技术,因其快速、平行化、高通量等特点,二十年来在国内外迅速发展。不仅提出了相关的基因芯片试验标准方案,还建立了用于储存全球基因芯片信息的数据库,供科研人员分析比对。论文综述了基因芯片的原理、质量控制中的关键问题及基本操作过程。目前基因芯片在动物传染病诊断、发病机制分析及药物筛选中得到广泛应用。
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动物病原高通量检测技术
《动物医学进展 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：当前规模化养殖业迫切需要动物病原检测技术高通量化。高通量检测技术具有高通量、自动化、微量化等特点。病原高通量检测技术可分为高通量免疫学检测(检测抗原)和高通量分子生物学检测(检测核酸)两大类。论文对近年来报道的用于动物病原高通量检测的基因芯片技术、抗体芯片技术、液相芯片技术、流式细胞术多色荧光分析技术、变性高效液相色谱技术等新技术从原理、特点及应用等进行了综述。
关键词： 高通量检测 液相芯片 抗体芯片 流式细胞术 基因芯片 变性高效液相色谱技术 病原微生物
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猪流感病毒低密度分型芯片的试验研究
《西南农业学报 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：根据猪流感病毒(swine influenza virus,SIV)H1N1、H3N2、H5N1和H9N2亚型的血凝素(HA)基因序列,分别设计各亚型的特异引物,并根据A型流感病毒的M基因序列设计引物,作为4种病毒亚型的通用引物。应用RT-PCR分别扩增各病毒亚型HA基因的特异片段和M基因片段,并克隆到pMD19-T Simple Vector构建重组质粒,经测序后,用于各病毒亚型探针的制备。将各探针按一定的阵列点加到硝酸纤维素膜上,制备成低密度基因芯片。在多重PCR过程中,用生物素标记的dUTP(Bio-11-dUTP)对待检样品进行标记,扩增产物与制备的基因芯片进行杂交,最后用扫描仪进行读片和分析。结果表明,该方法可以同时检测4种SIV病毒亚型,与PCR方法相比,显示了较高的灵敏度。该方法的建立,为SIV分型和猪流感疫情的监测提供了一种快速、灵敏和高通量的手段。
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六种禽病原检测的基因诊断芯片的研制及临床应用
《中国农业科技导报 》 2009
摘要：利用RT-PCR或PCR技术扩增出新城疫病毒(newcastle disease virus)、低致病性禽流感病毒(avian influenza)、传染性支气管炎病毒(infectious bronchitis virus)、减蛋综合征(egg drop syndrome)、传染性喉气管炎病毒(infectious laryngotracheitis)、鸡毒支原体(mycoplasma gallisepticum)基因的各一段保守序列,以纤维素膜作为生物芯片制作的基质,通过微量点样技术产生二维DNA探针阵列,即基因芯片(gene chip)。从可疑病料中提取病原核酸,通过RT-PCR掺入法标记bio-11-dUTP,将获得的标记PCR产物和基因芯片进行杂交,通过检测杂交信号的强弱来实现对生物样品的快速、高效检测及分析。芯片灵敏度高于RT-PCR和病毒分离,分别为RT-PCR和病毒分离的102倍和104倍,有忠实的特异性,动物实验结果符合率在95%以上。
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基因芯片技术在植物基因克隆中的应用研究进展
《基因组学与应用生物学 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：基因芯片是以预先设计的方式将大量的生物讯息密码(寡核苷酸、cDNA、基因组DNA等)固定在玻片、硅片等固相载体上组成的密集分子阵列。基因芯片技术本质是生物信号的平行分析,它利用核酸分子杂交原理,通过荧光标记技术检测杂交亲和与否,再经过计算机分析处理可迅速获得所需信息。由于其具有高通量、微型化、连续化、自动化、快速和准确等特点,已引起国际国内广泛的关注和重视,在许多领域得到了广泛的应用。本文简述了基因芯片的概念,技术特点及主要分类,着重对其在基因表达水平检测,基因突变和多态性的分析,基因组DNA分析,后基因组学研究以及转基因农作物检测等方面进行阐述,并说明其存在的问题及展望。
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狂犬病诊断基因芯片的建立和检测应用的初步研究
《中国预防兽医学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：根据已发表的狂犬病病毒(RV)的序列,设计合成能扩增高度保守核(N)蛋白片断的一对引物。通过生物素标记PCR技术,将核(N)蛋白基因片断作为探针点在硝酸素纤维膜上,制作成疾病诊断基因芯片。取160份可疑动物的血液,提取核酸作模板进行PCR扩增,将其产物与诊断基因芯片进行特异性逆向点杂交检测;并用蔗糖密度梯度离心和凝胶层析纯化狂犬病病毒作抗原,建立检测RV抗体的间接ELISA。把以上两种方法应用于临床,结果基因芯片的检测率比ELISA方法和(RT)PCR要高15%左右,表明建立的狂犬病诊断基因芯片具有更高的灵敏度和特异性。
关键词： 狂犬病病毒 基因芯片 间接ELISA (RT)PCR
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