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猪传染性胃肠炎病毒S蛋白的二级结构和B细胞抗原表位的预测

文献类型： 中文期刊

作者： 高传庆 1 ; 王可 2 ; 黄庆华 2 ; 韩虹 2 ;

作者机构： 1.滨州市畜牧兽医局

2.山东省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词： 猪传染性胃肠炎病毒;S蛋白;二级结构;B细胞抗原表位

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2010 年 12 期

页码： 12-16

摘要： 以TGEV(猪传染性胃肠炎病毒)基因组序列为基础,运用Garnier-Robson、Chou-Fasman和Karplus-Schulz方法预测其S蛋白的二级结构,运用Kyte-Doolittle方法对S蛋白的亲水性进行分析,并分别运用Jameson-Wolf方法和Emini方法预测了其抗原指数和表面可及`性,最后结合吴玉章的方法综合分析预测了其B细胞抗原表位。结果显示,α螺旋数量少且分散,β折叠占据面积较大,柔性区域主要集中在N端第22～30、45～76、100～172、239～301、348～419、451～519、541～633、645～720、746～796、822～887、921～986、1052～1201、1239～1384、1434～1445区段。S蛋白可能的B细胞抗原位点是N端第20～32、44～54、69～78、97～106、635～655、781～803、949～994、1307～1328、1346～1362、1432～1448区段,这些区段内部或附近都有柔性区域存在,可作为S蛋白的抗原优势表位。

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[1]猪传染性胃肠炎病毒N蛋白的二级结构和B细胞抗原表位的预*测. 姜宁朋,孙健全,黄庆华,王可. 2009

[2]传染性支气管炎病毒受体及其纤突蛋白受体结合域研究进展. 徐怀英,刘星丽,秦春芝,王友令,亓丽红,张玉霞,秦卓明. 2019

[3]红外光谱法研究铬对酵母细胞内蛋白二级结构的影响. 刘鹭,侯东军,陈锋亮,吕加平. 2012

[4]猪传染性胃肠炎病毒与猪呼吸道冠状病毒荧光RT-PCR鉴别检测方法建立与应用. 王慧珊,高志强,王金宝,张鹤晓,乔彩霞,吴亚琼,邢佑尚,朱淑芬. 2011

[5]紫甘蓝花色苷组成及抗猪传染性胃肠炎病毒活性分析. 雷用东,魏向利,罗小玲,童军茂,赵晓燕. 2015

[6]山东省猪腹泻病例中PEDV、TGEV和PRV的感染调查与分析. 王淞,曾昊,陈智,焦安琪,张树金,于江,孙文博,张玉玉,陈蕾,杜以军,李俊,吴家强,王金宝. 2017

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