您好，欢迎访问山东省农业科学院文献资源数据库平台

西洋梨水孔蛋白基因家族的全基因组鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 冉昆 1 ; 孙岩 1 ; 孙晓莉 1 ; 魏树伟 1 ; 王宏伟 1 ; 张勇 1 ; 王少敏 1 ;

作者机构： 1.山东省果树研究所

关键词： 西洋梨;水孔蛋白;全基因组分析;表达分析

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2016 年 17 卷 02 期

页码： 326-336

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 水孔蛋白(AQPs,aquaporins)是高效转运水分子的膜内在蛋白,具有丰富的多样性,在调控植物的水分关系中有重要作用。本研究利用西洋梨(Pyrus communis L.‘Bartlett’)基因组数据库,通过生物信息学手段鉴定西洋梨PcAQPs基因家族成员;并利用MEGA 6.0.5软件,采用邻接法构建系统发育树;利用GSDS 2.0软件进行基因结构分析,MEME程序进行Motif分析,AgBase v2.00程序进行GO分析;采用半定量RT-PCR技术研究PcAQPs基因组织表达情况。结果表明,西洋梨基因组中共有54个PcAQPs家族成员,均含有AQP特征结构域和保守的Motif基序,根据基因结构及系统进化分析可分为PIP、TIP、NIP和SIP等4个亚家族。不同基因间结构差别较大,但聚类关系较近的基因其结构类似。GO分析发现,多数PcAQPs基因具有转运蛋白活性,参与物质转运、应激反应、发育和代谢等生物学过程,但不同亚家族成员构成的细胞组分及参与的生物学过程具有明显差异。半定量结果表明,大多数PcAQPs基因在根、茎、叶和果实中均有表达,而且不同基因家族、不同基因间的组织表达模式存在差异。该研究为今后西洋梨PcAQPs基因的克隆和功能分析奠定了基础。

  • 相关文献

[1]花生水孔蛋白基因(AhAQ1)的克隆及盐胁迫下的表达分析(英文). 潘丽娟,杨庆利,江燕,禹山林. 2009

[2]杜梨质膜水孔蛋白基因PbPIP1的克隆与表达分析. 冉昆,孙晓莉,张勇,王宏伟,魏树伟,王少敏. 2016

[3]22种植物水孔蛋白理化性质及其结构特征的生物信息学分析. 冉昆,魏树伟,王宏伟,张勇,王少敏. 2015

[4]植物水孔蛋白研究进展. 张渝洁,全先庆,李新国. 2006

[5]一株裂解耐氨苄西林金黄色葡萄球菌的噬菌体及其生物学特性与全基因组分析. 张雪丽,于浩淼,闫振贵,杨少华,张亮,杨宏军. 2024

[6]花生GSTs家族基因的全基因组分析. 王通,迟晓元,王冕,潘丽娟,陈明娜,陈娜,焦坤. 2019

[7]西洋梨组培快繁及其叶片不定梢诱导研究. 孙清荣,孙洪雁,刘庆忠. 2002

[8]西洋梨新品种-鲜美、凯思凯德. 赵峰. 2003

[9]套袋对西洋梨表皮蜡质及抗氧化活性的影响. 杨雪梅,张元湖,王淑贞,王传增,董庆龙. 2013

[10]1-MCP处理对“早红考密斯”贮藏后货架期品质及香气组分的影响. 王传增,董飞,孙家正,季静,张雪丹,王丹,王超,王淑贞. 2014

[11]红色耐贮观赏兼用西洋梨新品种──红安久. 刘庆忠,赵红军,王茂生,崔佃胜,石立岩. 2000

[12]西洋梨品种'红考密斯'的组织培养及离体叶片不定梢再生. 孙清荣,关秋竹,孙洪雁. 2018

[13]早熟西洋梨新品种-紫巴梨. 高华君,王少敏. 2004

[14]西洋梨叶片直接再生体细胞胚. 孙清荣,刘庆忠,赵瑞华. 2003

[15]西洋梨红色新品种凯斯凯德的选育. 冉昆,王少敏,张勇,张坤鹏. 2015

[16]培养基及培养条件对西洋梨试管苗生根的影响. 孙清荣,刘庆忠,赵红军,刘鹏. 2004

[17]西洋梨新品种-凯斯凯德. 冉昆,王少敏. 2015

[18]西洋梨品种‘红考密斯’的组织培养及离体叶片不定梢再生. 孙清荣,关秋竹,孙洪雁. 2018

[19]Windows 7平台下BLAST本地化构建. 冉昆,王少敏. 2015

[20]西洋梨“丰产”叶片不定梢再生. 孙清荣,孙洪雁. 1999

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：山东省农业科学院文献资源数据库平台

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台