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基于RNA-Seq鉴定不同石榴品种间果实糖酸代谢基因

文献类型： 中文期刊

作者： 冯立娟 1 ; 付莹 2 ; 王传增 3 ; 杨雪梅 1 ; 尹燕雷 1 ; 陶吉寒 1 ;

作者机构： 1.山东省果树研究所

2.邹城市自然资源和规划局

3.山东省农业科学院黄河三角洲现代农业研究院

关键词： 石榴;转录组;糖酸代谢;差异基因;表达模式

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2022 年 58 卷 006 期

页码： 1161-1172

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 糖酸组分与含量是影响石榴果实品质的重要指标,研究其代谢机理能为石榴品质改良提供理论依据.本研究用Illumina高通量测序技术比较分析了石榴'泰山红'和'牡丹'成熟期的转录组数据,对糖酸代谢相关基因进行了鉴定和表达分析.结果表明,共获得51 670个差异表达基因,其中显著差异表达基因2 409个,不显著差异表达基因40 101个.在GO数据库中,7 502个差异基因被注释到3个类别46个亚类中,主要参与代谢过程和细胞过程.在KEGG代谢通路中,257个差异基因参与了19个代谢通路,代谢途径和次生代谢物生物合成途径得到显著富集.通过生物信息学分析,挖掘出参与石榴果实糖酸代谢的关键基因17个.qRT-PCR分析表明,2个石榴品种中TK基因的表达量最高,存在品种差异性.'泰山红'中FRK、SS、BGLU、UXS、FBA和4DH的表达量高于'牡丹'.石榴果实中,葡萄糖和果糖是主要的糖组分,酸以柠檬酸和苹果酸为主.

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