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不同生物型BVDV感染宿主细胞后差异基因分析

文献类型: 中文期刊

作者: 程凯慧 1 ; 朱彤 1 ; 侯佩莉 1 ; 王洪梅 1 ; 苗自利 1 ; 张亮 1 ; 解晓莉 1 ; 杨宏军 1 ; 何洪彬 1 ;

作者机构: 1.山东省农业科学院奶牛研究中心

关键词: 致细胞病变型BVDV;非致细胞病变型BVDV;差异基因;GO功能分析;Pathway显著性分析

期刊名称: 中国畜牧兽医

ISSN: 1671-7236

年卷期: 2017 年 11 期

页码: 3113-3120

收录情况: 北大核心

摘要: 为深入研究牛场中普遍存在的持续性感染,探讨不同生物型牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)转化的分子机制,本试验将致细胞病变型BVDV(CP型BVDV)和非致细胞病变型BVDV(NCP型BVDV)感染MDBK细胞,观察细胞变化,感染后12~72h期间每间隔12h收集1次细胞,同时对24、48h收集的细胞进行转录组学分析。结果显示,不同生物型BVDV感染宿主细胞24h后,与感染NCP型BVDV的细胞相比,感染CP型BVDV的MDBK细胞中上调差异表达的基因2 849个,下调差异表达的基因3 347个,48h后,上调差异表达的基因2 933个,下调差异表达的基因2 831个。对差异基因的GO功能分析结果表明,差异基因参与的分子功能主要有催化活性、结合活性、酶调节活性、分子转导活性和蛋白结合转录因子活性等;Pathway显著性富集分析结果显示,差异表达基因主要参与细胞自噬、细胞凋亡、免疫调节因子等相关的信号通路。本试验结果可为进一步揭示病毒致病的分子机制、控制BVDV和研制其候选疫苗奠定基础。

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