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麻核桃CBF基因的克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张建朋 1 ; 张士刚 2 ; 陈新 3 ; 徐丽 3 ; 贾建云 3 ; 张力思 3 ; 刘庆忠 3 ;

作者机构： 1.龙口市农业技术推广中心

2.泰安市农业局

3.山东省果树研究所/山东省果树生物技术育种重点实验室

关键词： 麻核桃;CBF基因;克隆;生物信息学分析

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2013 年 45 卷 11 期

页码： 7-11

摘要： CBF基因是植物CBF抗冷途径的枢纽,对增强植物抗冷能力极为重要。本研究根据已知的核桃CBF基因序列设计通用性引物,对麻核桃cDNA进行PCR扩增,成功获得麻核桃CBF基因全长序列,命名为JhCBF。JhCBF全长820 bp,包含一个645 bp的开放读码框(ORF),编码214个氨基酸。序列分析表明JhCBF与其他物种来源的CBF具有较高的同源性,其中,与桦木科白桦的同源性最高,为61.22%;JhCBF含有一个预测的AP2结构域及CBF特有的两段短肽序列。系统进化树分析表明JhCBF与桦木科白桦的亲缘关系最近,最先聚为一类。

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