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大蒲莲猪不同发育阶段组织RT-qPCR分析中适宜内参基因筛选

文献类型： 中文期刊

作者： 王彦平 1 ; 朱荣生 1 ; 王怀中 1 ; 王诚 1 ; 呼红梅 1 ;

作者机构： 1.山东省农业科学院畜牧兽医研究所;山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室

关键词： 大蒲莲猪;RT-qPCR;内参基因;geNorm;NormFind

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2018 年 S1 期

页码： 45-53

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用适宜数量且表达稳定的内参基因对目的基因的表达量进行标准化是获得准确、可靠RT-qPCR数据的重要条件。以不同日龄大蒲莲猪8种组织(心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、肠组织、肌肉、血液)为试验材料,使用ge Norm、Norm Find软件对8个常用候选内参基因(ACTB、B2M、GAPDH、RPL4、SDHA、TBP、YWHAZ、PPIA)的表达稳定性进行分析,筛选适宜内参基因及其组合。ge Norm、Norm Find软件联合分析结果表明,不同日龄大蒲莲猪心脏中表达最稳定的内参基因为TBP、PPIA和YWHAZ,肝脏、肾脏、肠组织和肌肉中最稳定的内参基因均为TBP和PPIA,脾脏中表达最稳定内参基因为TBP和RPL4,肺脏中表达最稳定内参基因为TBP、RPL4、PPIA和ACTB,血液中表达最稳定内参基因为ACTB、YWHAZ和GAPDH。由于大蒲莲猪8种体组织中最适宜内参基因组合和数量不同,因此内参基因筛选是进行RT-qPCR数据分析的必要条件。结果可为研究大蒲莲猪目的基因表达时适宜内参基因的选择提供帮助。

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