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基于高通量测序技术分析使它隆对玉米土壤细菌多样性的影响

文献类型: 中文期刊

作者: 许艳蕊 1 ; 方志军 2 ; 卢晓平 2 ; 郝鲁江 3 ;

作者机构: 1.齐鲁工业大学山东省微生物工程重点实验室;山东省农业科学院玉米研究所

2.;齐鲁工业大学山东省微生物工程重点实验室;山东省农业科学院玉米研究所

3.;齐鲁工业大学山东省微生物工程重点实验室;山东省农业科学院玉米研究所;

关键词: 使它隆;玉米土壤;高通量测序;细菌多样性

期刊名称: 微生物学报

ISSN: 0001-6209

年卷期: 2017 年 07 期

页码: 985-993

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】研究使它隆对玉米土壤细菌多样性的影响。【方法】利用Illumina Miseq高通量测序技术,分别测定了玉米土壤细菌的16S rRNA基因的V4-V5可变区序列,进而对不同时期的不喷施除草剂和喷施除草剂的玉米土壤中细菌群落组成和多样性进行分析。【结果】研究共获得260940条有效序列,167191条优质序列,12656个OTUs。多样性分析结果表明,使它隆处理10 d后的土壤细菌多样性和丰度降低;使它隆处理60 d后的土壤细菌多样性和丰度提高。对土壤细菌群落组成分析发现,5个土壤样品中的优势菌门均为酸酐菌门、变形菌门、放线菌门、绿弯菌门和芽单胞菌门。使它隆处理10 d后的样品酸杆菌门的比例增加,放线菌门和绿弯菌门的比例降低;使它隆处理60 d后样品变形菌门的比例降低,绿弯菌门的比例明显增加。【结论】使它隆对玉米土壤细菌多样性产生一定影响,其影响随施药时间而异。

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