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肉牛CAST基因5'UTR和3'UTR多态性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘振山 1 ; 刘桂芬 1 ; 宋恩亮 1 ; 刘晓牧 1 ; 谭秀文 1 ; 万发春 1 ;

作者机构： 1.山东省农业科学院畜牧兽医研究所/山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室

关键词： 鲁西黄牛;渤海黑牛;CAST基因;5'UTR;3'UTR;单核苷酸多态性

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2015 年 03 期

页码： 108-112

摘要： 钙蛋白酶抑制蛋白(Calpastatin,CAST)专一抑制钙蛋白酶(Calpain,CAPN)活性,参与调节牛肉的嫩化及肌内蛋白的水解,其编码基因是肉质性状的主要候选基因。本研究根据牛CAST基因5'UTR区(GenBank No.AY834771)和3'UTR区(Gen Bank No.DQ991097)序列设计两对引物,用PCR-SSCP方法对鲁西黄牛和渤海黑牛共305个样本进行了单核苷酸多态性分析。结果显示,CAST基因5'UTR和3'UTR区存在PCR-SSCP多态,在5'UTR区存在6437(C/T)、6477(G/A)和6614(G/T)3个SNP位点,表现为AA、AB、BB、BC和AD 5种基因型;在3'UTR区存在359(T/C)和366(A/G)2个SNP位点,表现为EE、EF、FF和EG 4种基因型。经检验表明,鲁西黄牛和渤海黑牛均处于非Hardy-Weinberg平衡状态;群体遗传多态性分析表明这两种牛的多态信息含量均为中度多态。

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