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小球藻Δ12脂肪酸去饱和酶基因的克隆与序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 迟晓元 1 ; 路延笃 2 ; 王明清 2 ; 卞曙光 2 ; 杨庆利 2 ; 秦松 2 ;

作者机构: 1.中国科学院海洋研究所

2.中国科学院海洋研究所;山东省花生研究所;中国科学院烟台海岸带可持续发展研究所;中国海洋大学;南京农业大学

关键词: 南极小球藻;脂肪酸去饱和酶;基因克隆;序列分析

期刊名称: 海洋科学

ISSN: 1000-3096

年卷期: 2009 年 33 卷 08 期

页码: 11-20

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用已报道的Δ12脂肪酸去饱和酶基因序列的保守区域,设计简并引物,通过RT-PCR的方法获得了小球藻NJ-7的内质网型Δ12脂肪酸去饱和酶基因(CvFAD2)的部分序列,然后采用RACE的方法分别克隆到5′片段和3′片段,拼接后设计特异引物扩增到全长cDNA。该基因全长为2 032 bp,ORF为1 158 bp,编码385个氨基酸,分子质量约为44 ku。根据已经得到的CvFAD2序列推导成氨基酸序列与一些已知物种的FAD2氨基酸序列相比较,同源性分别为普通小球藻(Chlorella vulgaris)75%,莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)57%,石榴(Punica granatum)57%,麻疯树(Jatropha curcas)52%。系统发育分析表明,南极小球藻CvFAD2基因与真核微藻(衣藻和普通小球藻)的FAD2基因聚在一起,介于真菌与高等植物之间,并且真核微藻FAD2基因与高等植物的同源性更高,推测其在进化上与高等植物的亲源关系更近。

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