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核桃Y_2SK_2型脱水素基因JrDHN的克隆、表达和单核苷酸多态性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 徐丽 1 ; 陈新 2 ; 魏海蓉 2 ; 张力思 2 ; 宗晓娟 2 ; 王甲威 2 ; 朱东姿 2 ; 刘庆忠 2 ;

作者机构: 1.山东省果树研究所

2.山东省果树研究所,山东省果树生物技术重点实验室

关键词: 核桃;脱水素基因;定量RT-PCR;单核苷酸多态性

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2014 年 41 卷 08 期

页码: 1573-1582

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用RT-PCR和RACE技术从‘香玲’核桃(Juglans regia L.‘Xiangling’)叶片中克隆了1个脱水素基因JrDHN(GenBank登录号KC503061.1),其全长1 056 bp,具有528 bp的开放阅读框,编码175个氨基酸组成的多肽,具有LEA家族成员的特征多肽序列,属于典型的Y2SK2型脱水素。以核桃18S基因为内参,对‘香玲’核桃JrDHN在4℃胁迫下的表达模式进行了初步的研究,结果表明低温诱导下叶片中JrDHN的表达增加,4℃处理4 h后达到最大值;自然越冬条件下,花芽中JrDHN表达量呈先上升后下降的趋势,在12月份表达量最高,推测JrDHN在核桃对低温胁迫响应中发挥重要功能。‘香玲’JrDHN在雌花中表达量高,其次是叶片和树皮,在花芽中最低。单核苷酸多态性分析JrDHN序列中有30个SNPs位点和11个Indels;单倍型分析显示12份核桃材料可分为10个单倍型,单倍型多样性为0.9697。

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