您好,欢迎访问山东省农业科学院文献资源数据库平台

我国鸭肝炎病毒分离株基因组的测定与分析

文献类型: 中文期刊

作者: 马秀丽 1 ; 宋敏训 2 ; 于可响 2 ; 廖明 1 ; 辛朝安 1 ;

作者机构: 1.农业部养禽与禽病防治重点开放实验室

2.山东省农业科学院

关键词: 鸭病毒性肝炎病毒(DHV);分离株;基因组测序;基因组分析

期刊名称: 华南农业大学学报

ISSN: 1001-411X

年卷期: 2009 年 30 卷 01 期

页码: 80-86

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 对我国鸭病毒性肝炎病毒(Duck hepatitis virus,DHV)分离株YZ和CL的全基因组进行了序列测定分析.结果表明,2分离株的基因组全长分别为7 713 nt和7 709 nt,包括626 nt的5′UTR、6 747 nt的ORF、314 nt的3′UTR以及23 nt和19 nt的poly(A)尾.结构蛋白VP0含有保守的四肽CPRP,VP3的N端存在一段约20个氨基酸的碱性氨基酸富集区域;VP1缺少RGD(Arg-Gly-Asp)基序.DHV2分离株存在3个不相关的2A蛋白基序,其中2A1蛋白类似口蹄疫病毒属的2A蛋白,2A2蛋白与AIG1蛋白(拟南芥)和GTPase更为相似,2A3蛋白则与副肠孤病毒属的2A2蛋白类型相似;2C蛋白含有保守基序EPxxxxxxGxxGxGK(S/T)、QxxxxxDDxxQ和KGxxxxSxxxxxS/T.3C蛋白含有催化三联体H38-D69-C144;3D蛋白包含KDELR、DxxxxD、GxxSGxxxTxxxNx、YGDD和FLKR等RNA聚合酶的特征基序.基于多聚蛋白、VP1、2C和3C蛋白的进化关系分析结果均表明,DHV分离株与副肠孤病毒属的遗传关系最近,但占据一个清晰的独立遗传谱系,应将DHV单独划属.

  • 相关文献

[1]新型鸭肝炎病毒分离株JFX08全基因组测定与分析. 赵立娜,马秀丽,李玉峰,黄兵,宋敏训,李建亮,崔言顺. 2010

[2]三株新型鸭源微RNA病毒分离毒株的全基因组序列分析. 李继桐,朱彤,吕俊峰,高月花,胡峰,于可响,宋敏训,王建琳,李玉峰. 2024

[3]新城疫LaSota活疫苗对基因Ⅶ型分离株的免疫保护性试验. 胡北侠. 2013

[4]用气管环交叉中和试验鉴定IBV山东分离株的血清型. 秦卓明,赵继勋,陆友龙,刘红,金维江,张世栋,贾强,孙树清,高峰. 2000

[5]新城疫LaSota活疫苗对基因Ⅶ型分离株的免疫保护性试验. 胡北侠,杨少华,许传田,张琳,黄艳艳,张秀美. 2012

[6]一例小反刍兽疫疑似病例的确诊及其遗传进化分析. 赵贵民,王洪梅,雷安民,于力,何洪彬. 2014

[7]2006-2012年山东不同宿主新城疫分离株F和HN基因的分子特征. 徐怀英,秦卓明,王友令,黄兵,李玉峰. 2012

[8]鹅副粘病毒GD分离株的蚀斑纯化及F基因的克隆与序列分析. 王友令,袁小远,徐怀英,秦卓明. 2006

作者其他论文 更多>>