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高灌蓝莓CBF基因的单核苷酸多态性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王甲威 1 ; 林科 2 ; 魏海蓉 1 ; 刘庆忠 1 ;

作者机构: 1.山东省果树研究所/山东省果树生物技术育种重点实验室

2.泰山学院

关键词: CBF;单核苷酸多态性(SNP);蓝莓

期刊名称: 山东农业科学

ISSN: 1001-4942

年卷期: 2014 年 02 期

页码: 14-16

摘要: 本研究以21个高灌蓝莓品种为试材,克隆VcCBF基因,测序后分析其单核苷酸多态性(SNP),共克隆到123个非重复序列,发现120个SNP位点,单核苷酸多态性发生频率为1/695bp,核苷酸多态性值(Pi)为0.01251。在120个SNP位点中,单态突变位点62个;简约信息位点58个,其中双突变55个,三突变3个。对其碱基替换方式进行分析发现,转换91个,颠换26个,转换与颠换的发生比率为3.5∶1。通过单倍型分析发现,21个蓝莓品种的VcCBF基因存在5种单倍型。

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