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花生GSTs家族基因的全基因组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王通 1 ; 迟晓元 1 ; 王冕 1 ; 潘丽娟 1 ; 陈明娜 1 ; 陈娜 1 ; 焦坤 1 ;

作者机构： 1.山东省花生研究所/农业部花生生物学与遗传育种重点实验室

关键词： 花生;谷胱甘肽转移酶;基因家族;全基因组分析

期刊名称： 花生学报

ISSN： 1002-4093

年卷期： 2019 年 04 期

页码： 25-34

收录情况： 北大核心

摘要： 谷胱甘肽转移酶(glutathione-S-transferase, GST)是一类重要的多功能超家族酶,普遍存在于植物体中,作为配体或结合蛋白,在调控植物的生长发育、解除外界毒素作用过程起到重要作用。为全面了解花生GSTs基因家族的结构特性,本论文通过生物信息分析技术对花生GST基因家族进行全基因组鉴定和表达特性分析,结果表明,在花生全基因组中一共有163个GSTs基因,其中A组基因中含有76个,B组基因中含有87个。基因结构和发育进化树将花生GST基因分为6类:Tau、Theta、Lamda、EF1Bγ、Phi和DHAR,花生GST家族基因结构进化相对保守,但各基因的内含子数量及长度有较大差异,其中EK5R9的外显子数最多,达19个;而K7JNV的内含子最长,约18 kb。MEME分析发现,花生GST家族基因中存在9个保守域,各基因中的保守结构域为6～8个不等。染色体定位显示,花生GSTs家族基因在花生A、B染色体组上呈不均匀分布,在A02、A03、A07、A09、B02、B03、B05、B08和B09号染色体上存在1～2个基因簇。表达分析发现,只有80个花生GST基因具有组织表达差异,其中6个的组织表达有极显著差异。本研究为GSTs基因的功能研究及花生抗逆性提高提供了理论依据。

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