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甜樱桃类钙调蛋白基因家族的生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 吴军平 1 ; 付全娟 1 ; 郭远鹏 1 ; 侯森 1 ; 孙玉刚 1 ; 魏国芹 1 ;

作者机构: 1.山东农业大学;山东省果树研究所;鄄城县国有第一林场

关键词: 甜樱桃;CML基因家族;生物信息学分析

期刊名称: 落叶果树

ISSN: 1002-2910

年卷期: 2024 年 56 卷 002 期

页码: 32-39

摘要: 类钙调蛋白(CML)是植物生长发育过程中应对刺激的一种重要蛋白,基于甜樱桃全基因组,利用生物信息学的方法对甜樱桃CML基因家族成员进行鉴定,并对理化性质、染色体定位、基因结构、启动子作用元件等进行分析.结果表明,PavCML家族有49个基因,不均匀的分布于1~8号染色体上,亚细胞定位在细胞质、叶绿体、细胞核等部位,启动子顺式作用元件分析发现PavCML家族基因响应多种元件.与转录组数据结合进行荧光定量PCR分析,结果显示CML在裂果部位的相对表达量高,表明该基因可能参与裂果过程,为CML家族基因的功能鉴定提供理论依据.

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