文献类型: 中文期刊
作者: 张晓亮 1 ; 张志刚 2 ; 赵智中 2 ; 宋希云 1 ; 李巧云 2 ;
作者机构: 1.青岛农业大学生命科学学院
2.山东省农业科学院蔬菜所/国家蔬菜改良中心山东分中心/山东省设施蔬菜生物学重点实验室
关键词: 大白菜;芜菁花叶病毒;EST-SSR
期刊名称: 中国农学通报
ISSN: 1000-6850
年卷期: 2012 年 28 卷 10 期
页码: 121-126
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了研究大白菜抗芜菁花叶病毒(TuMV),对大白菜及芸薹属中与抗性有关的EST序列进行了搜索和SSR筛选,并根据SSR两端的序列设计引物,以1对大白菜TuMV抗、感材料的基因组DNA为模板,对上述引物进行了筛选。结果表明,在132条大白菜EST和895条芸薹属抗性EST序列中,共筛选出166个符合条件的SSR(16.2%)。其中包含6种核苷酸重复基元,占主导地位的分别是二核苷酸重复(33.7%)和三核苷酸重复(50.0%),其余重复类型所占比例较小。根据上述SSR两翼的序列,共设计引物196对。引物筛选结果表明,能够进行成功扩增的有156对,占79.6%,其中35对引物在2份材料中具有多态性。因此,利用芸薹属中抗性有关的EST序列设计SSR引物,可用于大白菜TuMV抗性有关基因的标记。
- 相关文献
[1]大白菜、萝卜芜菁花叶病毒系统进化及CP序列分析. 吴斌,张眉,姜珊珊,张安盛,崔汉青,辛志梅,马立平,王升吉. 2018
[2]大白菜芜菁花叶病毒病抗性遗传分析. 李巧云,张志刚,刘栓桃,卢金东,赵智中. 2012
[3]大白菜中保护酶活性及H_2O_2含量变化与TuMV抗性关系的研究. 张志刚,李巧云,刘栓桃,张晓亮,赵智中. 2013
[4]TuMV-Nib反义基因对大白菜的遗传转化研究. 于占东,赵双宜,何启伟,王翠花,牟晋华,刘春香,康静. 2006
[5]大白菜EST-SSR反应体系优化及引物筛选. 佟海申,宋琳,张志刚,赵智中,宋希云,李巧云. 2010
[6]大白菜EST-SSR标记开发中非SSR标记的鉴别. 周新成,刘立峰,李化银,高建伟. 2010
[7]抗芜菁花叶病毒转基因大白菜的研究. 于占东,吉林农业大学园艺学院,赵双宜,何启伟,王翠花,牟晋华,刘春香. 2005
[8]EST sequencing and SSR marker development from cultivated peanut (Arachis hypogaea L.). Li, Meng Jun,Xiao, Han,Wang, Xing Jun,Xia, Han,Zhao, Chuan Zhi,Bi, Yu Ping,Tang, Rong Hua. 2010
[9]柿树的EST-SSR标记开发. 王静,颜芹,王洁,黄月娇,闫晓雨,李佳慧,张丽,张萌,薄文浩. 2018
[10]花生SSR分子标记的开发与利用. 王金彦,杨庆利,禹山林. 2009
[11]萝卜EST-SSR标记PCR反应体系的建立与优化. 付卫民,王淑芬,王秀峰,何启伟,刘贤娴,韩晓雨. 2012
[12]高羊茅EST-SSR标记的开发及品种鉴定. 段乃彬,王建成,于天祥,孔素萍,李群,张文兰,戴双. 2010
[13]山羊EST资源的SSR分析. 赵传志,李爱芹,李长生,刘波,夏晗,王兴军,贾文斌. 2009
[14]NCBI和cDNA文库中栽培花生EST-SSR分子标记的开发及其特点(英文). 王金彦,潘丽娟,杨庆利,禹山林. 2009
[15]西花蓟马EST-SSR信息分析、标记筛选及其与Genomic-SSR的多态性比较. 段惠生,张安盛,赵传志,于毅,褚栋. 2012
[16]EST-SSR标记在冬小麦品种DUS测试中的应用. 张晗,姚凤霞,刘永杰,宋卫华,许金芳. 2010
[17]萝卜EST-SSR反应体系的建立与优化. 韩晓雨,王淑芬,魏佑营,刘贤娴,付卫民. 2011
[18]黑麦草EST-SSR分子标记开发及生物信息学分析. 王秀华,李家丽,蒲艳艳,丛晓翔,林雪婷,于鸿翔,赵岩. 2016
[19]番茄EST-SSR标记PCR反应体系的优化. 韩明利,侯丽霞,崔娜,王施慧,于志海,郭彩杰. 2011
[20]黄淮海地区主要冬小麦品种的EST-SSR遗传多样性分析. 张晗,姚凤霞,刘永杰,王东建,许金芳,李汝玉. 2010
作者其他论文 更多>>
-
叠抱大白菜杂种优势利用模式分析
作者:王树彬;王荣花;张志刚;王立华;刘栓桃;李巧云;许念芳;赵智中
关键词:叠抱大白菜;杂种优势;配合力;完全双列杂交;重测序
-
早/晚抽薹性大白菜自交系中光敏色素B及光周期关键基因的动态研究
作者:刘栓桃;王树彬;王荣花;王立华;李巧云;张志刚;赵智中
关键词:大白菜;PHYB;光周期;抽薹;蛋白质印迹
-
中国玉米种子质量:十年变迁和未来展望
作者:鲁苗苗;辛婷婷;贾濡;张佳欣;李贺勤;赵延明;张海艳;李朝霞;裴玉贺;赵美爱;韩登旭;袁志鹏;张巧巧;李莉;陈全全;杜雪梅;薛艳芳;夏海勇;刘铁山;汪黎明;何军光;马云国;王宝卿;陈景堂;宋希云;岳海旺;顾日良;王建华;江绪文
关键词:玉米;种子质量;种子活力
-
大白菜LACS家族基因鉴定与表达分析
作者:王荣花;王树彬;刘栓桃;张志刚;李巧云;王立华;赵智中
关键词:大白菜;LACS家族;蜡质;生物信息学分析;基因表达
-
大白菜KCS基因家族鉴定及在蜡粉近等基因系中表达分析
作者:王荣花;王树彬;张志刚;赵智中;李巧云;王立华;刘栓桃
关键词:大白菜;KCS基因家族;蜡质;多倍化;表达分析
-
大白菜抗根肿病分子标记研究进展
作者:刘栓桃;王树彬;王荣花;张志刚;李巧云;王立华;赵智中
关键词:大白菜;芸薹根肿菌;抗性位点;分子标记;候选基因
-
8个新收集大白菜杂交种DNA指纹构建及其与已有种质的亲缘关系分析
作者:刘栓桃;王立华;张志刚;王荣花;王树彬;李巧云;赵智中
关键词:大白菜;杂交种;DNA指纹;亲缘关系




