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大白菜抗芜菁花叶病毒(TuMV)EST-SSR信息分析与引物筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 张晓亮 1 ; 张志刚 2 ; 赵智中 2 ; 宋希云 1 ; 李巧云 2 ;

作者机构: 1.青岛农业大学生命科学学院

2.山东省农业科学院蔬菜所/国家蔬菜改良中心山东分中心/山东省设施蔬菜生物学重点实验室

关键词: 大白菜;芜菁花叶病毒;EST-SSR

期刊名称: 中国农学通报

ISSN: 1000-6850

年卷期: 2012 年 28 卷 10 期

页码: 121-126

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了研究大白菜抗芜菁花叶病毒(TuMV),对大白菜及芸薹属中与抗性有关的EST序列进行了搜索和SSR筛选,并根据SSR两端的序列设计引物,以1对大白菜TuMV抗、感材料的基因组DNA为模板,对上述引物进行了筛选。结果表明,在132条大白菜EST和895条芸薹属抗性EST序列中,共筛选出166个符合条件的SSR(16.2%)。其中包含6种核苷酸重复基元,占主导地位的分别是二核苷酸重复(33.7%)和三核苷酸重复(50.0%),其余重复类型所占比例较小。根据上述SSR两翼的序列,共设计引物196对。引物筛选结果表明,能够进行成功扩增的有156对,占79.6%,其中35对引物在2份材料中具有多态性。因此,利用芸薹属中抗性有关的EST序列设计SSR引物,可用于大白菜TuMV抗性有关基因的标记。

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