文献类型： 中文期刊
作者： 王荣花 1 ; 王树彬 1 ; 张志刚 1 ; 赵智中 1 ; 李巧云 1 ; 王立华 1 ; 刘栓桃 1 ;
作者机构： 1.山东省农业科学院蔬菜研究所 国家蔬菜改良中心山东分中心 山东省设施蔬菜生物学重点实验室 农业部黄淮地区蔬菜科学观测实验站 (山东)
关键词： 大白菜;KCS基因家族;蜡质;多倍化;表达分析
期刊名称： 生物技术通报
ISSN： 1002-5464
年卷期： 2022 年 38 卷 004 期
页码： 86-96
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： β-酮脂酰辅酶A合成酶(β-ketoacyl-CoA synthase,KCS)是超长链脂肪酸合成中的限速酶,通过对大白菜KCS基因家族鉴定分析,为揭示KCS在控制大白菜蜡质性状中的具体功能研究奠定了基础.利用生物信息学的分析方法鉴定大白菜KCS基因家族成员,分析其亲缘关系、蛋白质理化性质、染色体定位、共线性关系、基因结构、蛋白保守域结构和基因表达模式.从大白菜全基因组共鉴定到32个BrKCS基因成员分成4个亚组,不均匀地分布在10条染色体上.BrKCS氨基酸长度和分子量的范围分别为181-755 aa和20.54-84.83 kD.共线性分析表明BrKCS5、BrKCS8和BrKCS13等7个家族成员与拟南芥共线性的BrKCS基因发生两倍化,1个家族成员(BrKCS9)发生了三倍化.基因结构分析显示,不同成员编码的氨基酸序列外显子数目及位置存在差异.转录组分析表明,BrKCS5、BrKCS6b与BrKCS10b基因在大白菜不同器官/组织尤其在花器官中可能参与蜡粉的合成.qRT-PCR分析结果验证了转录组数据的可靠性.综上所述,从大白菜全基因组共鉴定到32个BrKCS,其中3个基因在蜡粉近等基因系中表达量高且差异显著,为解析BrKCS基因在控制大白菜蜡质性状中的分子机制奠定了基础.
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