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核桃SSR反应体系的优化

文献类型： 中文期刊

作者： 刘晓丽 1 ; 何天明 2 ; 张美勇 3 ; 张立杰 1 ; 慈志娟 1 ; 张春雨 1 ; 陈学森 1 ;

作者机构： 1.山东农业大学果树生物学实验室

2.塔里木大学植物科技学院

3.山东省果树研究所

关键词： 核桃;SSR;优化

期刊名称： 果树学报

ISSN： 1009-9980

年卷期： 2007 年 24 卷 02 期

页码： 140-145

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以清香、香铃、爱米格为试材,利用CTAB法提取基因组DNA,将PCR体系的主要成分设定5个梯度,根据每个成分的变化引起的PCR-SSR的效果差异,探讨了核桃SSR技术中PCR体系的主要成分对扩增结果的影响,并对引物WGA321的适宜退火温度进行优化。最终确定了引物WGA321的最适退火温度为48～52℃,PCR反应体系的最佳条件为:15μL体系中,Mg2+1.0mmol/L,dNTPs浓度0.40mmol/L,TaqE用量为0.5U,DNA模板1.0ng/μL,引物浓度为0.4μmol/L。利用此反应体系对部分核桃品种进行PCR扩增并电泳检测,扩增结果清晰且有较高的多态性,表明该体系适合核桃的亲缘关系分析。

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