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基于高通量测序的菟丝子生防菌"鲁保一号"转录组学研究

文献类型： 中文期刊

作者： 李健 1 ; 李美 1 ; 高兴祥 1 ; 房锋 1 ;

作者机构： 1.山东省农业科学院植物保护研究所

关键词： 鲁保一号;菟丝子;转录组;高通量测序

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2021 年 001 期

页码： 26-31

摘要： "鲁保一号"是对菟丝子具有良好防效的生防菌,由于其致病力退化和分子遗传信息的匮乏,对于该菌的深入研究受到了限制。为进一步挖掘"鲁保一号"菌株的遗传资源,获得致病力退化相关的功能基因,本研究运用新一代高通量测序技术（Illumina Hiseq 2500）对"鲁保一号"菌株进行转录组测序分析。结果表明,获得了总长度为31 126 662 bp的unigene序列信息;对序列进行组装拼接后获得17 031条单基因簇（unigene）,平均长度为1 827.65 bp。序列同源性比较表明,86.04%的序列与已知炭疽菌序列有不同程度的同源性。将unigene与KOG数据库进行比对,根据其功能大致分为25类,其中注释最多的是一般功能预测类基因,其次是翻译后修饰、蛋白折叠和分子伴侣类基因。针对测序得到的基因信息,筛选获得6个CDC相关基因,分为3个亚组。本研究通过对"鲁保一号"菌株进行高通量测序,获得了丰富的转录组信息,为新基因的挖掘和基因组学的研究奠定了基础。

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