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代谢组学-转录组学联合分析不同品种柿叶矿物质含量差异

文献类型： 中文期刊

作者： 余贤美 1 ; 王洁 1 ; 高瑞 1 ; 龚榜初 1 ; 艾呈祥 1 ;

作者机构： 1.山东省果树研究所;中国林业科学院亚热带林业研究所

关键词： 柿叶;矿物质吸收;转录组学分析;代谢组学分析;联合分析

期刊名称： 生物工程学报

ISSN： 1000-3061

年卷期： 2023 年 07 期

页码： 2986-3002

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 柿叶含有丰富的钙、铁、锰、锌等人体必需的矿质元素，不同柿树品种，其柿叶中矿质元素的组成和含量有着明显差异。本研究以‘君迁子’(Diospyros Lotus Linn,DL)为对照，采用代谢组学-转录组学联合分析，研究了‘黑柿’(Diospyros kaki.Hei Shi,HS)、‘西村早生’(Diospyros kaki Thunb.Nishimurawase,NM)、‘泰富’(Diospyros kaki Thunb.Tai Fu,TF)鲜嫩柿叶中矿质元素的含量差异。代谢组学分析显示，从DL vs.HS、DL vs.NM和DL vs.TF中分别获得了382、391和368个差异代谢产物(differentially accumulated metabolites,DAMs)，其中229个为共同DAMs。经RNA测序，获得了182 008个单基因(unigenes)，平均长度为652 bp，从DL vs.HS、DL vs.NM和DL vs.TF中分别获得了2 598、3 503和3 333个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。经基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析，分别从DL vs.HS、DL vs.NM和DL vs.TF中获得了9、12和12个与矿物质吸收相关的DEGs，其中6个为共同DEGs，每百万碱基测序的转录本序列每千碱基序列片段数(fragments per kilobase of transcript sequence per millions base pairs sequenced,FPKM)值差异倍数为1.34–6.15，经实时荧光定量PCR (quantitative real-time polymerase chain reaction,q RT-PCR)验证，其表达趋势均与RNA测序结果一致，相对表达水平差异倍数为0.26–10.21。转录组学数据分析和q RT-PCR验证结果表明，‘黑柿’鲜嫩柿叶中含有较高含量的矿物质，‘西村早生’和‘泰富’次之。联合分析显示，6个DEGs与其代谢产物呈正相关。本研究结果说明，3个柿树品种中，‘黑柿’的鲜嫩柿叶可推荐用于富含矿质元素柿叶茶的制作。

  • 相关文献

[1]同时测定6种柿叶黄酮类物质方法的建立. 安淼,余贤美,王洁,刘加芬,艾呈祥. 2016

[2]17个柿品种叶中黄酮类物质的检测. 安淼,余贤美,王洁,刘加芬,艾呈祥. 2017

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