文献类型： 中文期刊

作者： 辛忠昊 ¹ ; 郭效珍 ² ; 逯晓寒 ¹ ; 焦安琪 ³ ; 刘丽萍 ² ; 于江 ³ ; 黄兵 ² ; 孙淑红 ¹ ; 吴家强 ¹ ;

作者机构： 1.山东农业大学动物科技学院

2.山东省农业科学院家禽研究所山东省家禽疫病诊断与免疫重点实验室

3.山东省农业科学院畜牧兽医研究所山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室

关键词： 猪流行性腹泻病毒;流行毒株;分离鉴定;遗传变异

期刊名称： 生物学杂志

ISSN： 2095-1736

年卷期： 2022 年 003 期

页码： 12-17,35

收录情况： CSCD

摘要： 猪流行性腹泻（PED）是由猪流行性腹泻病毒（PEDV）引起猪的一种急性高度接触性肠道传染病。为了解山东地区PEDV的遗传进化趋势，对2020—2021年收集的疑似猪流行性腹泻的临床病料进行RT-PCR检测。随后将处理好的病料上清液接种于Vero细胞进行PEDV病毒分离，并利用间接免疫荧光（IFA）进行验证，成功分离到一株PEDV毒株，命名为QH-202105。将分离株传代培养至第10代，提取RNA后进行扩增并全基因组测序，结合NCBI下载的参考序列对分离株的全基因组和S基因进行核苷酸同源性比对、系统发育树构建分析，结果显示，分离株与美国分离株USA/Colorado/2013核苷酸同源性最高，为99.1%,与CHM2013株同源性最低，为96.5%。经S基因氨基酸序列分析显示，分离株QH-202105在S基因的N端有60多处突变，两处氨基酸插入（包括第59～62位氨基酸的QGVN 4个氨基酸插入，第145位氨基酸N的插入）和两处氨基酸缺失（第115～118氨基酸的缺失，第167～168氨基酸的缺失）。进化树分析结果显示，分离毒株QH-202105为G2基因群，与CH/HNAY/2015和CH/ZJCX-1/2012亲缘关系最近，属同一进化分支。在此基础上，应用PROVEAN对QH-202105的S蛋白突变氨基酸进行功能预测，结果显示，在1 361处（G→C）被判定为“Deleterious”,可以推测此处的突变对病毒的侵袭力可能存在间接影响。研究结果可为我国PEDV变异株的流行情况及防控提供参考。