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水稻DA1基因的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李爱芹 1 ; 李利斌 2 ; 方志军 3 ; 刘国明 4 ;

作者机构： 1.山东省农业科学院高新技术中心

2.山东省农业科学院蔬菜研究所

3.山东省农业科学院试验农场

4.寿光市台头镇农业综合服务站

关键词： 水稻;DA1;结构;顺式元件;遗传进化

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2009 年 08 期

页码： 11-14

摘要： 本文采用比较基因组学和生物信息学的方法,首次从水稻基因组中鉴定出一个与拟南芥控制种子和器官大小的基因DA1同源的基因,命名为OsDA1,并对这个基因的序列特征、编码蛋白的结构域、顺式元件以及遗传进化进行了分析。结果表明,OsDA1编码的蛋白具有LIM结构域、泛素互作位点和锌指结构域,与拟南芥DA1蛋白的结构一致,推测二者在控制器官发育上具有类似的功能。本研究还发现,在水稻OsDA1基因的启动子区存在多个响应不同激素和逆境信号的顺式元件,但这些元件的类型与拟南芥DA1基因的顺式元件有所不同,OsDA1与AtDA1可能在表达调控上有所不同;OsDA1基因不仅能够控制种子等器官的大小和发育,而且还可能与植物的激素信号转导和逆境响应有关。本文为下一步研究OsDA1在水稻生长发育和逆境响应中的功能以及与水稻杂种优势的关系奠定了基础。

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