文献类型： 中文期刊
作者： 杜泰峰 1 ; 侯夫云 2 ; 秦桢 2 ; 王庆美 2 ; 张立明 2 ;
作者机构： 1.山东师范大学生命科学学院
2.山东省农业科学院作物研究所农业部黄淮海薯类科学观测实验站
关键词： 甘薯近缘野生种;转录因子;WRKY;生物信息学分析
期刊名称： 分子植物育种
ISSN： 1672-416X
年卷期： 2021 年 003 期
页码： 730-745
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： WRKY基因家族是一类含有WRKY保守结构域的转录因子大家族,是植物中最大的转录调控因子家族之一。目前已有多种植物WRKY家族的分析鉴定报告,但关于甘薯（Ipomoea batatas （L.） Lam.）中WRKY家族的报告却很少。本研究利用生物信息学方法对甘薯近缘野生种三浅裂野牵牛Ipomoea trifida（Kunth） G. Don的基因组数据进行了详细的分析,结果显示:在三浅裂野牵牛基因组中共鉴定得到82个WRKY转录因子,其中81个不均匀分布在基因组的15条染色体上,第5号染色体上分布最多（10个基因）,第8和15号染色体上分布最少（2个基因）;蛋白分子大小在116～710个氨基酸之间,等电点为4.85～10.33不等;按照保守结构域分类可以分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三组,Ⅱ组包含Ⅱa、Ⅱb、Ⅱc、Ⅱd和Ⅱe五个亚组,其中Ⅰ组有15个ItWRKY基因、Ⅱa组4个、Ⅱb组11个、Ⅱc组23个、Ⅱd组7个Ⅱe组10个、Ⅲ组12个;82个ItWRKY基因中有8个基因的核心结构域WRKYGQK发生了单个氨基酸变化（WRKYGKK）。ItWRKY基因以组织特异性的方式表达且在不同胁迫下基因的表达量存在差异,表明ItWRKY基因参与了三浅裂野牵牛对胁迫的响应。本研究为甘薯WRKY基因的功能鉴定提供了参考作用,进一步为甘薯的分子育种提供了帮助。
- 相关文献
[1]葡萄全基因组WRKY转录因子鉴定和分析. 苏玲,王鹏飞,杨阳,任凤山,王咏梅,陈万钧. 2019
[2]Genome-Wide Identification and Characterization of WRKY Gene Family in Peanut. Song, Hui,Wang, Pengfei,Zhao, Chuanzhi,Bi, Yuping,Wang, Xingjun,Lin, Jer-Young. 2016
[3]蒺藜苜蓿WRKY转录因子密码子使用偏好性分析. 宋辉,王鹏飞,马登超,夏晗,赵传志,张烨,赵术珍. 2015
[4]野生花生AdWRKY37基因的克隆及表达分析. 王鹏飞,王月华,胡子滢,赵传志,陈万钧,王咏梅. 2017
[5]利用生物技术改良植物脂肪酸提高植物含油量的研究. 夏晗,王兴军,李孟军. 2009
[6]新的玉米NAC类基因ZmNAC1的克隆与功能分析. 柳展基. 2008
[7]DREB/CBF转录因子植物抗逆性研究进展. 董亚茹,王应民,王向誉. 2017
[8]花生转录因子AhbHLH18克隆与功能分析. 赵小波,闫彩霞,李春娟,党彦学,孙全喜,王奇,邱俊兰,单世华. 2022
[9]软枣猕猴ICE1基因克隆与生物信息学分析. 张庆田,范书田,李昌禹,艾军,秦红艳. 2019
[10]甜樱桃MYB转录因子基因的克隆与表达分析. 魏海蓉,宗晓娟,朱东姿,谭钺,徐丽,陈新,王甲威,刘庆忠. 2018
[11]植物ANT类转录因子研究进展. 丁谦,宋晴晴,杨发斌,李景娟,李化银,张一卉,王凤德,高建伟. 2018
[12]基于转录组分析不同着色桃果皮花青苷表达模式与转录因子. 何平,李林光,王海波,常源升. 2019
[13]花生中低温胁迫相关转录因子基因的筛选. 陈娜,迟晓元,程果,潘丽娟,陈明娜,王通,王冕,杨珍,禹山林. 2016
[14]盐胁迫条件下花生转录因子表达分析. 赵小波,闫彩霞,李春娟,王娟,姜常松,单世华. 2017
[15]核桃油脂合成转录因子JrWRI1基因的克隆及生物信息学分析. 王贵芳,王文茹,张淑辉,相昆,徐颖,张美勇. 2019
[16]F3'5'H对马铃薯花青素合成的调控. 刘芳,杨元军,陈广侠,霍雨猛,毕玉平. 2018
[17]盐胁迫条件下花生应答转录因子鉴定与分析. 秦圣豪,韩燕,崔凤,刘译阳,万书波,李国卫. 2018
[18]绒毛白蜡2个MYB转录因子的活性鉴定及其表达分析. 李田,彭振英,范仲学,毕玉平. 2013
[19]利用基因工程改良植物脂肪酸和提高植物含油量的研究进展. 夏晗,王兴军,李孟军,肖寒. 2010
[20]植物SPL转录因子研究进展. 李明,李长生,赵传志,李爱芹,王兴军. 2013
作者其他论文 更多>>
-
氮素不同控释期对甘薯光合特性及干物质积累与分配的影响
作者：马存金;孔宪奎;李广华;谷彦冰;王娟;张哲;王庆美
关键词：甘薯[Ipomoea batatas(L.)Lam.];氮素;控释期;光合特性;干物质积累与分配
-
烯效唑处理对甘薯产量、土壤残留和后茬小麦生长的影响
作者：解备涛;张海燕;张立明;仲可成;陈亚华;王庆美;李爱贤;侯夫云;李广华;段文学
关键词：甘薯;烯效唑;产量;叶面喷施;滴灌;土壤残留;小麦
-
4种杀菌剂对甘薯茎腐病的防治效果研究
作者：侯夫云;李爱贤;秦桢;周媛媛;李广华;王庆美
关键词：甘薯;茎腐病;杀菌剂;防治效果
-
菜用甘薯品种评价及营养品质分析
作者：田一汝;解备涛;段文学;孔凡丽;董顺旭;张海燕;张立明
关键词：菜用甘薯;品种比较;食用品质;营养品质;产量
-
甘薯CLE多肽家族的全基因组鉴定和IbCLE12的克隆及抗旱性表达分析
作者：周媛媛;赵春玲;侯夫云;李爱贤;秦桢;王庆美;董顺旭
关键词：甘薯;CLE多肽;生物信息学分析;IbCLE12;基因表达;抗旱性
-
甘薯IbbZIP22基因克隆与表达分析
作者：孟鑫;王庆美;侯夫云;李爱贤;董顺旭;周媛媛;秦桢;张立明
关键词：甘薯;IbbZIP22基因;克隆;表达分析;启动子;淀粉
-
基于文献计量的甘薯栽培学科研究现状及热点分析
作者：张海燕;解备涛;段文学;孟静;唐研;梅林;孔庆富;王磊;汪宝卿;张立明
关键词：甘薯;文献计量;栽培学科;研究现状;研究热点
