您好,欢迎访问山东省农业科学院文献资源数据库平台

甘薯CLE多肽家族的全基因组鉴定和IbCLE12的克隆及抗旱性表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 周媛媛 1 ; 赵春玲 2 ; 侯夫云 1 ; 李爱贤 1 ; 秦桢 1 ; 王庆美 1 ; 董顺旭 1 ;

作者机构: 1.山东省农业科学院作物研究所

2.山东师范大学

关键词: 甘薯;CLE多肽;生物信息学分析;IbCLE12;基因表达;抗旱性

期刊名称: 山东农业科学

ISSN:

年卷期: 2023 年 005 期

页码: 1-7

摘要: CLAVATA3/Embryo surrounding region-related(CLE)多肽作为植物体内小分子信号激素,在植物的生长发育和抗逆性中发挥重要的调控作用。本研究从甘薯近缘野生种Ipomoea trifida的基因组数据库中筛选出12个ItfCLE基因,并对其结构、蛋白理化性质、进化关系以及转录水平的表达进行了分析。结果表明,12个ItfCLE蛋白的长度和分子量分别为81~154 aa和9.0~17.5 kDa;均具有C末端保守基序(VSKRKVPSGPBPJHN);除了ItfCLE2和ItfCLE6,均为不稳定蛋白;除了ItfCLE5,均为亲水性脂溶蛋白;亚细胞定位表明均为胞外分泌型小肽。进化分析表明这12个CLE多肽属于5个不同的亚组。表达模式分析表明,各ItfCLE基因在不同组织中的表达不同,ItfCLE9和ItfCLE10在花中表达较高,ItfCLE4和ItfCLE12在根中表达较高,ItfCLE2、ItfCLE6和ItfCLE8在茎中表达较高;ItfCLE12基因受干旱诱导表达最高,ItfCLE8受干旱和盐胁迫诱导上调表达。进一步从甘薯栽培种济薯25中克隆ItfCLE12的同源基因IbCLE12,实时荧光定量结果表明IbCLE12受PEG6000干旱和ABA处理诱导显著上调表达,推测IbCLE12在甘薯抗旱性中发挥重要的调控作用。本研究结果可为进一步解析甘薯CLE多肽家族功能及IbCLE12基因在甘薯抗旱性中的分子机制奠定基础。

  • 相关文献

[1]石榴蔗糖代谢相关酶SPS和INV基因家族鉴定与表达分析. 冯立娟,李英朋,王传增,尹燕雷,郭琳,谭伟. 2024

[2]大白菜LACS家族基因鉴定与表达分析. 王荣花,王树彬,刘栓桃,张志刚,李巧云,王立华,赵智中. 2022

[3]陆地棉膜结合脂肪酸去饱和酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 陈义珍,李浩,傅明川,王立国,刘任重,柳展基. 2023

[4]不同甘薯品种抗旱性评价及耐旱指标筛选. 张海燕,解备涛,汪宝卿,董顺旭,段文学,张立明. 2019

[5]水分胁迫对不同抗旱型核桃幼苗叶绿素荧光参数的影响. 相昆,张美勇,徐颖,李宪利. 2009

[6]葡萄干旱胁迫反应机理的研究进展. 张加魁,王恒振,史红梅. 2009

[7]葡萄干旱胁迫反应机理的研究进展. 张加魁,王恒振,史红梅. 2009

[8]栽培种花生FAE1基因的克隆和序列分析. 张欣,孙全喜,吴琪,王秀贞,胡东青,唐月异,王志伟,宋国生,徐建志,殷冬梅,王传堂. 2018

[9]菠菜SpNHX1基因的克隆及生物信息学分析. 张海洋,付娆,李茹霞,顾寅钰,梁晓艳,宋延静,李萌,王向誉,郭洪恩. 2019

[10]洋葱黄酮醇合成酶基因的克隆与表达分析. 王振宝,杨妍妍,刘冰江,霍雨猛,李艳伟,孙亚玲,吴雄. 2022

[11]花生AOC基因家族的鉴定和表达分析. 张浩,李春娟,陆晓东,苑翠玲,刘风珍,孙全喜,单世华. 2021

[12]洋葱伯克霍尔德氏菌CAS19嗜铁素合成相关基因cepR的克隆及生物信息分析. 杨芩,余贤美,贺春萍,郑服丛. 2010

[13]蓝莓角鲨烯环氧化酶基因的克隆与表达分析. 陈新,徐丽,张力思,宗晓娟,魏海蓉,王甲威,谭钺,朱东姿,洪坡,刘庆忠. 2019

[14]玉米ZmWRKY36基因的生物信息学及功能分析. 王文丽,穆春华,张发军,刘霞,冷冰莹,姚国旗,闫振伟,刘巍,王昀,张恩盈. 2023

[15]甘薯近缘野生种三浅裂野牵牛WRKY基因家族的生物信息学分析. 杜泰峰,侯夫云,秦桢,王庆美,张立明. 2021

[16]核桃JrCOR基因的克隆及表达分析. 徐丽,陈新,张力思,魏海蓉,刘庆忠. 2018

[17]水稻类受体蛋白激酶基因OsESG1的克隆与生物信息学分析. 房孝良,刘炜. 2012

[18]水稻干扰素相关发育调节因子的生物信息学分析. 和亚男,李稳,尹俊雅,谢先芝. 2021

[19]菠菜NHX家族基因鉴定及其响应盐胁迫的表达分析. 李茹霞,顾寅钰,李萌,陈传杰,梁晓艳,李俊林,邢延富,张海洋,付娆. 2021

[20]大白菜GID1家族基因鉴定及表达模式分析. 宋晴晴,张慧敏,张烨,张一卉,李景娟,李化银,贺立龙,王凤德,高建伟. 2020

作者其他论文 更多>>