科研产出
不同树盘覆盖对矮砧苹果园土壤微生物群落结构和多样性的影响
《生态学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：以7年生矮化中间砧苹果为试材,研究了不同材质树盘覆盖对土壤微生物丰度、群落结构和多样性的影响。高通量测序结果表明,防水园艺地布和塑膜覆盖处理提高了0—20 cm土层变形菌门的相对丰度和20—40 cm土层变形菌门的相对丰度,防水园艺地布处理还显著提高了土壤细菌Ace和Simpson指数。相较于防水、塑膜覆盖处理,透水园艺地布不仅提高了0—20 cm土层变形菌门、接合菌门的相对丰度,而且提高了土壤细菌Ace、Chao1和Simpson指数,降低了土壤真菌Ace、Chao1和Simpson指数。树状聚类图结果显示,树盘覆盖显著改变了土壤细菌和真菌群落结构,以透水园艺地布覆盖处理的改变最为显著。综合分析认为,不同覆盖措施均有利于提高土壤细菌群落的丰富度和多样性,降低土壤真菌群落的丰富度和多样性,优化土壤微生物群落结构,其中以透水园艺地布覆盖的效果最好。
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基于高通量测序分析玉米浸泡副产物中细菌群落结构和多样性
《山东农业科学 》 2021 北大核心
摘要：为了更加全面了解玉米浸泡副产物中微生物多样性,比较其中细菌群落结构,利用高通量测序技术,对玉米浸泡液、玉米浆及玉米喷浆粉中细菌16S rRNA V4区进行测序,进而分析细菌多样性和群落组成结构。结果表明:共获得190 069条有效数据,通过聚类获得352个OTUs,隶属于12门、68纲、183属。α多样性分析结果表明,玉米喷浆粉中Shannon指数明显高于玉米浸泡液和玉米浆。微生物群落组成分析发现,在门水平上,厚壁菌门（Firmicutes）是玉米浸泡液、玉米浆及玉米喷浆粉的共同优势菌门;在属水平上,乳杆菌属（Lactobacillus）为玉米浸泡液、玉米浆及玉米喷浆粉的优势属;在种水平上,玉米浸泡液中优势菌为耐酸乳杆菌（L.acetotolerans）,玉米浆及玉米喷浆粉中优势菌为解淀粉乳杆菌（L.amylolyticus）。
关键词： 玉米浸泡副产物 高通量测序 细菌 群落结构 多样性
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黄河三角洲芦苇根际氨氧化微生物的空间分布
《山东农业科学 》 2020
摘要：芦苇是黄河三角洲常见的典型盐生植物,氨氧化微生物是硝化过程的主要驱动者.本研究以黄河三角洲不同地区的芦苇根际土为研究对象,采用荧光定量PCR技术及MiSeq高通量测序技术,基于arch-amoA及amoA基因对氨氧化古菌(AOA)及氨氧化细菌(AOB)丰度、多样性及群落分布进行比较分析.结果表明,昌邑(CY)、寿光(SG)、东营(DY)、滨州(BZ)4个采样点的芦苇根际土中均以AOA占主导,根际土中AOA丰度显著高于根周土.芦苇根际AOA多样性表现为寿光>滨州>东营>昌邑,AOB多样性表现为昌邑>滨州>寿光>东营.昌邑和寿光两地的芦苇根际AOA和AOB群落结构相似,东营和滨州两地的芦苇根际AOA和AOB群落组成差异较小.其中昌邑和寿光两地芦苇根际土中参与氨氧化过程的主要AOA类群为亚硝化球菌(Nitrososphaera),AOB类群为亚硝化弧菌属(Nitrosovibrio)和亚硝化螺菌属(Nitrosospira);滨州和东营两地的芦苇根际AOA类群主要为Nitrosopumilus,东营芦苇根际中的AOB几乎全为亚硝化螺菌属(Ni-trosospira),滨州芦苇根际中的AOB主要为亚硝化螺菌属(Nitrosospira)和亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas).可见,黄河三角洲芦苇根际氨氧化微生物的组成存在空间分布差异.
关键词： 黄河三角洲 芦苇根际 氨氧化微生物 amoA基因 荧光定量PCR 高通量测序
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黄河三角洲芦苇根际固氮微生物的空间分布特征
《河南农业大学学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：以黄河三角洲不同地区芦苇根际土为研究对象,采用荧光定量PCR技术及MiSeq高通量测序技术,对基于nifH基因的固氮菌丰度、多样性及群落分布进行比较分析.结果表明,黄河三角洲地区芦苇根际固氮微生物存在空间分布差异(P<0.001),丰度表现为东营(1.31*108 copies·g-1)>滨州(9.47*107 copies·g-1)>昌邑(2.39*106 copies·g-1)>寿光(1.59*106copies·g-1);α多样性表现为滨州>东营>寿光>昌邑.MiSeq高通量测序显示黄河三角洲芦苇根际固氮菌主要以变形菌门(Proteobacteria)为主,昌邑芦苇根际优势固氮菌属为农杆菌属(Agrobacterium),寿光根际优势固氮菌属为固氮螺菌属(Azospirillum),滨州芦苇根际优势固氮菌属分别为慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium),东营芦苇根际根际优势固氮菌属为慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium),基于UniFrac的聚类树分析发现滨州和东营间固氮菌群落组成以及结构差异较小,寿光与其他样本的差异性较大,总氮、含水量和含盐量是影响黄河三角洲地区芦苇根际固氮菌丰度、群落结构的主要环境因子.
关键词： 芦苇 根际微生物 固氮 荧光定量PCR 高通量测序
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玉米粗缩病抗性相关miRNA的筛选
《山东农业科学 》 2020
摘要：水稻黑条矮缩病毒(Rice black streaked dwarfvirus,RBSDV)引起的玉米粗缩病是我国玉米生产中的一类重要病害,严重威胁我国玉米生产.MicroRNA(miRNA)是一类内源的小分子非编码RNA,作为真核生物基因表达中的一类调控因子,在抵御病毒入侵方面起着非常重要的作用.本研究通过对不同抗性玉米品种人工接种RBSDV,构建茎秆及叶片miRNA文库共8个.利用高通量测序,共获得150个已知miRNA前体序列和474个新miRNA序列.miRNA差异表达分析表明,两品种间叶片组织中表达趋势相反的miRNA有17个,茎秆组织中表达趋势相反的miRNA有10个.对差异表达的miRNA进行靶基因预测,共得到1870个靶标基因,通过KEGG和GO富集分析,得出差异表达miRNA的表达模式.本试验为玉米抗粗缩病分子机理研究奠定了基础.
关键词： 玉米粗缩病 水稻黑条矮缩病毒 miRNA 高通量测序
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微生物菌剂对猪粪堆肥中细菌群落结构的影响
《应用生态学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：以猪粪和小麦秸秆做堆肥试验,处理组添加外源微生物菌剂,利用常规方法对堆肥样品进行理化性状测定,采用高通量测序技术分析堆肥过程中细菌群落特征.理化性状测定结果表明:添加外源菌剂可延长堆肥高温时间,降低堆肥发酵末期的pH,增加全氮含量,加快C/N的下降.主成分分析表明:外源菌剂影响堆肥样品细菌群落的稳定性.门分类水平上,厚壁菌门、变形菌门和绿弯菌门的相对丰度在处理组中较高;纲分类水平上,梭状芽孢杆菌纲、α-变形菌纲和γ-变形菌纲在处理组的升温期和高温期相对丰度增加;科分类水平上,小单孢菌科和梭状芽孢杆菌纲的消化链球菌科、梭菌科以及盐厌氧菌科的相对丰度在处理组的升温期和高温期均呈上升趋势.Pearson相关性分析表明,盐胞菌属与外源菌剂呈显著正相关,而氨苄芽孢杆菌属与外源菌剂呈显著负相关.研究表明,猪粪堆肥中添加外源菌剂可使堆肥的理化性质和细菌群落结构均发生显著变化.
关键词： 猪粪 高通量测序 外源菌剂 理化参数 微生物群落 Pearson相关性热图
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基于高通量测序分析青贮玉米微生物多样性
《山东农业科学 》 2020
摘要：青贮饲料发酵质量好坏很大程度上由其微生物组成决定.为了解青贮玉米微生物的多样性,利用高通量测序技术结合传统的纯培养技术,对31个青贮饲料样本进行微生物多样性分析.结果表明,青贮玉米微生物群落组成的共享核心菌属41个,占总样本微生物组成的87. 7%,丰度较大的(≥1%)有10个菌属,其中乳杆菌属、克雷伯菌属及魏斯氏菌属分别占42. 9%、12. 1%、10. 3%;真菌主要有念珠菌属、黑粉菌属、半乳糖霉菌属等.比较乳熟期组与蜡熟期组青贮的微生物群落,发现玉米的成熟度不同,青贮发酵产品中某些属微生物在数量上存在差别,但微生物群落组成无明显差异.本研究可为青贮饲料微生物群落结构及功能的研究提供参考.
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生物有机肥对红富士树体生长及土壤微生物群落结构的影响
《中国土壤与肥料 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：以7年生烟富3苹果为试材,探讨了45%有机肥和生物有机肥(葡萄籽肥和海藻肥)对果树生物量及土壤微生物环境的影响,为果树优质高效生产和减量施用化肥提供科学依据.试验共设置3个处理:45?%有机肥11?250?kg/hm2(E)、海藻有机肥11?250?kg/hm2(F)、葡萄籽有机肥4?500?kg/hm2(G),于果实成熟期采集土壤样品及果实,测定其生物量及果实品质等相关指标,应用高通量测序技术研究不同处理后不同土层微生物多样性的变化.与45%有机肥处理对照相比较,生物有机肥处理后提高了树体的株高、冠径、产量和品质,海藻肥处理后树体叶丛枝和短果枝比例、平均单果质量以及果实品质均优于葡萄籽肥,外围新梢表现为葡萄籽肥最高.对于0~20?cm土层,海藻肥处理后显著降低了土壤细菌Simpson指数,提高了土壤细菌Shannon指数,葡萄籽肥处理结果与此相反;海藻肥和葡萄籽肥处理均提高了土壤0~20?cm土层真菌Ace、Chao1和Simpson指数,降低了Shannon指数.对于20~40?cm土层,海藻肥处理后降低了土壤细菌和真菌Ace、Chao1和Shannon指数,显著提高了Simpson指数,葡萄籽肥处理结果与此相反.海藻肥处理后提高了0~20和20~40?cm土层酸杆菌门(Acidobacteria)的相对丰度,降低了变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)的相对丰度;葡萄籽肥处理后降低了0~20和20~40?cm土层酸杆菌门的相对丰度,提高了0~20?cm土层变形菌门的相对丰度,降低了20~40?cm土层变形菌门的相对丰度,降低了0~20?cm土层拟杆菌门的相对丰度,提高了20~40?cm土层拟杆菌门的相对丰度.子囊菌门(Ascomycota)和接合菌门(Zygomycota)是土壤中含量最丰富的两大真菌,对0~20?cm土层来说,海藻肥和葡萄籽肥处理均提高了子囊菌门的相对丰度,降低了接合菌门的相对丰度,对20~40?cm土层来说,海藻肥和葡萄籽肥处理均提高了接合菌门的相对丰度,海藻肥处理提高了子囊菌门的相对丰度,较对照提高了56.88%,葡萄籽肥处理降低了子囊菌门的相对丰度.土壤物种丰度聚类热图结果显示不同土层之间存在差异,葡萄籽肥处理与对照处理之间差异较大.葡萄籽肥和海藻肥处理均有助于红富士树体树高、干径、东西冠径以及外围新梢的增大,且枝类结构更为合理,不同生物有机肥处理后改变了土壤细菌和真菌的群落多样性及结构,土壤细菌多样性增加,真菌多样性降低,改善了土壤微生物环境,为生物有机肥的推广奠定了?基础.
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木霉拌种剂对小麦根际土壤真菌群落多样性的影响
《山东科学 》 2019
摘要：采用Illumina Miseq高通量测序平台,对木霉LTR-2拌种剂拌种小麦后不同发育时期小麦根际土壤真菌进行测序,分析群落丰富度、多样性以及结构。结果表明,木霉拌种处理小麦可以增加小麦根际真菌群落的丰富度,对真菌群落的均匀度影响不明显,但真菌群落的优势度有明显的增加;木霉拌种处理后小麦根际土壤真菌的菌群结构构成相近,没有发生明显变化,但各真菌类群所占比例发生了明显的变化,其中一些病原真菌如链格孢属、赤霉属、镰刀菌属所占比例较不拌种处理均有所降低。该研究为木霉菌LTR-2防治小麦土传病害的生防机制提供了理论依据。
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不同生草处理对苹果园土壤微生物群落的影响
《应用生态学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：以自然生草为对照,采用高通量测序技术分析种植黑麦草、白三叶、鼠茅草和长柔毛野豌豆对山东省阳谷县苹果园土壤微生物群落的影响,并揭示其与土壤养分含量及理化性质的相关性.结果表明:种植黑麦草可提高土壤中链格孢菌和曲霉的相对丰度,白三叶处理可提高土壤赤霉的相对丰度,鼠茅草处理可增加土壤短梗菌属和毛壳属真菌的相对丰度,长柔毛野豌豆处理可增加土壤亚硝化螺菌和绿僵菌等有益菌的相对丰度,而自然生草则会使土壤青枯菌等病原细菌数量增加.Spearman相关性分析发现,土壤芽孢杆菌与有机质呈极显著正相关;曲霉与速效磷、速效钾和阳离子交换量(CEC)、有机质呈显著负相关;绿僵菌与pH、CEC呈显著正相关.研究表明,苹果园行间种植长柔毛野豌豆,有助于在一定程度上提高土壤有机质及养分含量,改善土壤微生态环境.
关键词： 果园生草 高通量测序 相对丰度 多样性指数 土壤养分
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