科研产出
牛MBL1基因启动子区单核苷酸多态性
《中国农业科技导报 》 2011 CSCD
摘要：为研究牛甘露糖结合凝集素1(mannose-binding lectin 1,MBL1)基因启动子区单核苷酸多态性,采用聚合酶链式反应限制片长多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)、单链构象多态性(single-strand conformation polymorphism,SSCP)及直接测序的方法检测了1 073头中国荷斯坦奶牛、69头鲁西黄牛和24头渤海黑牛启动子区-2194(A>C)、-1446(T>C)、-1330(G>A)三个位点的不同基因型分布。结果表明,在-2194位点和-1330位点处渤海黑牛只检测到两种基因型(AA/AC,GG/GA);而鲁西黄牛群体中在-1330位点处没有检测到AA型。三个品种牛群在该三个位点的优势等位基因相同,分别为A、C、G,频率为A(CH 0.900 1/LYC 0.760 9/BBC 0.937 5)、C(CH 0.604 8/LYC 0.768 1/BBC 0.625)和(CH 0.725 1/LYC0.869 6/BBC 0.895 8)。三个品种牛的优势等位基因相对保守,需进一步研究分析这3个多态位点与牛生产性状的关系。
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牛Src基因三个内含子单核苷酸多态性
《华北农学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：采用巢式PCR、DNA测序、创造酶切位点法PCR(Created restriction site-PCR,CRS-PCR)及PCR-RFLP(Poly-merase chain reaction-restriction fragment length polymorphism assay)方法,研究中国荷斯坦牛、鲁西黄牛及渤海黑牛的Src基因内含子6,8,9的单核苷酸多态性(SNPs),发现了14062(C/T)、17302(G/A)和18107(T/C)共3个SNPs,均为首次报道的位点。Src基因14062(C/T)、17302(G/A)和18107(T/C)3个位点在中国荷斯坦牛和鲁西黄牛两个群体中的优势等位基因相同,分别为C、G、C,其等位基因频率分别为0.671/0.647、0.583/0.640、0.558/0.577,而渤海黑牛在这三个位点的优势等位基因分别为T、G、C,其等位基因频率分别为0.525,0.913,0.763。经χ2适合性检验,中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛三个群体在14062(C/T)位点均达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);在17302(G/A)位点则均未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05);中国荷斯坦牛和鲁西黄牛在18107(T/C)位点均达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),而渤海黑牛未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。中国荷斯坦牛和鲁西黄牛在14062(C/T)和18107(T/C)位点均表现为中度多态(0.25 全文链接
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牛LAP3基因内含子12和外显子13单核苷酸多态性
《中国农业科技导报 》 2010
摘要：采用单链构象多态性(single-strand conformation polymorphism,SSCP)、创造酶切位点PCR(createdrestriction site-PCR,CRS-PCR)、限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)以及直接测序方法,研究中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛LAP3基因第12内含子和第13外显子的单核苷酸多态性(SNP)。共检测到5个SNP,分别为24 794(T/G)、24 803(T/C)、24 846(T/C)、24 564(G/A)和25 415(T/C),其中24 564(G/A)为首次报道的位点。经PCR-SSCP结合测序图谱发现24 794(T/G)、24 803(T/C)、24 846(T/C)位点完全连锁,但该连锁位点在鲁西黄牛群体中未检测到。5个SNP位点在中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛群体的优势等位基因相同,分别是T、T、T、G、T,其等位基因频率分别是T(CH0.579/LY 1/BB 0.722)、T(CH0.579/LY1/BB 0.722)、T(CH0.579/LY1/BB 0.722)、G(CH0.584/LY0.775/BB 0.500)和T(CH0.596/LY 0.796/BB 0.750),多态信息含量均在0.25至0.5之间,属于中度多态。
关键词： 牛 LAP3基因 单核苷酸多态性 单链构象多态性 优势等位基因
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牛CXC趋化因子受体1基因(CXCR1)编码区单核苷酸多态性
《农业生物技术学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：采用巢式PCR、DNA测序和CRS-PCR方法,研究了牛(Bos taurus)3个品种中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛的chemokine(C-X-Cmotif)receptor1(CXCR1)基因编码区的单核苷酸多态性(SNPs),发现了819(G/A)、995(G/A)和1008(C/T)3个SNPs,其中995(G/A)和1008(C/T)为首次报道的2个位点,995(G/A)导致氨基酸的改变Arg422His。CXCR1基因819(A/G)、995(A/G)和1008(C/T)3个位点在中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛群体的优势等位基因相同,分别为G、G和C,其等位基因频率分别为0.63/0.73/0.71、0.60/0.85/0.71和0.74/0.76/0.71。经χ2适合性检验,鲁西黄牛在995(A/G)和1008(C/T)位点达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);渤海黑牛的所有位点均达到Hardy-Weinberg平衡状态,荷斯坦牛在3个位点均未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。3个品种牛在819(A/G)和1008(C/T)位点均表现为中度多态(0.25 全文链接
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奶牛GHR基因CRS-PCR多态性及其与产奶性状的关联分析
《农业生物技术学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：采用PCR-RFLP技术对中国荷斯坦牛生长激素受体(GHR)基因第8外显子进行单核苷酸多态性分析。结果表明,GHR基因经TasⅠ酶切后产生2种等位基因和3种基因型。等位基因A和T的频率分别为0.6339和0.3661。基因型AA、AT和TT的频率分别为0.4558、0.350和0.191。测序分析表明TT型和AA型相比在GHR基因第4962位碱基处发生T→A突变,该突变导致氨基酸由苯丙氨酸(TTT)变为酪氨酸(TAT)。χ2适合性检验表明,GHR基因的TasⅠ酶切位点处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05)。最小二乘分析表明:基因型TT所对应的乳脂率最小二乘均值显著高于基因型AA所对应的最小二乘均值(P<0.05)。
关键词： 中国荷斯坦牛 生长激素受体基因(GHB) 产奶性状 单核苷酸多态性 创造酶切位点PCR(CRS-PCR)
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