科研产出
大白菜杂交种和亲本之间基因表达差异分析
《中国蔬菜 》 2012 北大核心
摘要：利用cDNA-AFLP技术研究大白菜白引2号杂交种及其亲本在幼苗期、莲座期、结球期的基因差异表达。结果表明:在3个发育期,发现有29条差异片段,其中5个差异片段出现在幼苗期,14个差异片段出现在莲座期,10个差异片段出现在结球期;19个差异片段在杂种中表达,3个差异片段在双亲中同时表达,2个差异片段仅在母本中表达,5个差异片段仅在父本中表达。将29个差异片段的序列在白菜基因组序列数据库网站(http://brassicadb.org/brad/)进行BLAST分析,均找到了对应的染色体位置。其中17个差异片段分别有明确的基因及编码蛋白与其相对应。其中有两个基因片段分别含有AP2/EREBP结构域和PPR结构域,这两个结构域在控制植物生长发育方面具有重要作用。
关键词： 大白菜 杂交种 亲本 基因差异表达 cDNA-AFLP
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利用cDNA-AFLP分析大白菜、萝卜及其杂交种差异表达基因
《山东农业科学 》 2011
摘要：为更好地理解十字花科蔬菜杂种优势的分子机理,对大白菜(Brassica rapa L. ssp. pekinensis)、萝卜(Raphanus sativus L.)及其杂交种的差异表达基因进行了初步研究。利用cDNA-AFLP技术对杂种F1及其双亲进行基因差异表达分析,共得到44个在杂种F1特异表达的差异片段,分属40个Unigene;通过Blast搜索,有43个差异片段可以在GenBank数据库中找到同源序列(包括EST序列),其中仅32个序列功能已知。这些已知功能基因参与了碳代谢、激素合成、转录、细胞周期、物质运输、信号转导、逆境响应和花发育等相关过程。
关键词： 基因差异表达 大白菜 萝卜 杂种F1 cDNA-AFLP
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