科研产出
基于SSR标记的石榴品种遗传多样性分析和指纹图谱构建
《山东农业科学 》 2023 北大核心
摘要：为明确国内主产区不同主栽石榴品种的遗传多样性,构建DNA指纹图谱,本研究以 30 个石榴品种为试材,利用琼脂糖凝胶电泳和毛细管电泳筛选多态性引物,建立了石榴品种SSR分子标记鉴定体系,然后利用样品信息与指纹代码配置组合的串联代码,构建了不同石榴品种的DNA指纹图谱.结果表明,从 36 对引物中筛选出扩增产物条带清晰稳定、多态性高的引物 10 对,共检测出 48 个等位基因,平均为4.8个,观察杂合度和期望杂合度平均分别为 0.50 和 0.60,Shannon's 指数和Nei's多样性指数平均分别为 1.11 和 0.59,多态信息含量在 0.33~0.72 之间,平均为 0.53.聚类分析发现,30 个品种被分为 3 组,A组包括 16 个品种,B组包括 8 个品种,C组包括 6 个品种.基于样品、引物和等位基因信息,构建了 30 个品种的特异指纹代码及指纹图谱二维码.本研究结果可为石榴种质资源分子鉴定及开发利用提供理论依据.
关键词： 石榴品种 SSR分子标记 遗传多样性 DNA指纹图谱
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八倍体草莓DNA指纹图谱的构建与初步遗传分析
《中国农业大学学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为对草莓品种进行分子鉴定,从59对SSR引物中筛选出18对多态性好的引物,采用毛细管电泳检测方法对84份八倍体草莓品种进行标记分析,检测每个标记等位变异大小,并进行初步遗传分析.将每个引物对84份草莓扩增的带型按照一定原则进行数字标注,为了简化编码,引物Pl~P18分别编号为字母A~R,将引物编号与相应的带型编码进行组合得到该样品在特定引物的扩增产物编码,按照18对引物顺序串联这些编码形成该品种的DNA指纹图谱.结果表明:18对SSR引物共扩增得到多态性条带150个,不同引物扩增到多态性条带数4~17个,共检测到377个带型;各引物的多态性信息含量(PIC)值为0.494~0.908,平均值为0.738;利用18对SSR引物共构建了 84个草莓品种的DNA指纹图谱.聚类分析结果表明:在遗传相似系数为0.99时能将所有品种区分开,一些来源相同的品种被优先聚在一起.综上,本研究成功构建84个草莓品种的DNA指纹图谱,这些品种遗传关系较近.
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