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资源类型: 中文期刊
关键词:遗传演化分析(模糊匹配)
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山东地区10株H9N2亚型禽流感病毒HA和NA基因的遗传演化分析

《中国动物传染病学报 》 2018 北大核心

摘要:为了解2016年山东地区H9N2亚型禽流感病毒的变异情况,选取分离鉴定的10株H9N2亚型禽流感病毒分离毒株,分别对其HA和NA基因进行序列测定和分子特性分析,并应用Mega 5.0软件绘制相应的基因氨基酸进化树,进行遗传进化分析。结果表明:10株H9N2分离毒的HA裂解位点氨基酸均为RSSR/GLF,具有典型低致病性AIV HA基因的特征;其第226位氨基酸均为亮氨酸(L),因此具有结合人流感受体的分子特性。同时这10株病毒的NA基因颈部均有9个核苷酸的缺失,且NA的潜在糖基化位点均不超过8个。进化树分析表明,2016年山东地区H9N2流行毒株HA和NA基因均属A/Chicken/Beijing/1/1994亚群,并且同属于近几年在中国鸡群中流行的G57分支。

关键词: 禽流感病毒 H9N2亚型 HA基因 NA基因 遗传演化分析

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2016年山东地区10株H_9N_2亚型禽流感病毒HA基因的遗传演化分析

《家禽科学 》 2018

摘要:为了解2016年山东地区H_9N_2亚型禽流感病毒的变异情况,选取2016年所分离的10个H9N2亚型禽流感病毒株,对其HA基因进行测序,并应用DNAStar和Mega5.0生物软件拼接序列和建立进化树。结果表明,10株H_9N_2分离毒的HA裂解位点氨基酸均为-RSSR/GLF-,有6~8个潜在的糖基化位点,具有典型低致病性禽流感病毒HA基因的特征,但其226位氨基酸均为亮氨酸(L),呈现出人流感受体结合特性。进化树分析表明,2016年山东地区H_9N_2流行毒株HA基因属于A/Duck/Hong-Kong/Y280/97亚群,同属于近几年在中国鸡群中流行的以A/chicken/Zhejiang/HJ/2007为代表的G57分支。

关键词: H9N2 HA 遗传演化分析

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