应用混合遗传距离和基因型值遗传距离构建植物遗传资源核心子集(英文)

王建成; 胡晋; 徐海明; 《生物数学学报 》 2011 北大核心 CSCD

摘要：将连续性的基因型值数据和间断性的分子标记数据整合建立混合遗传距离,对比了应用混合遗传距离和单纯应用基因型遗传距离构建植物遗传资源核心子集的效果.应用混合线性模型中的调整无偏预测法(AUP)预测基因型值,结合不加权类平均法(UPGMA)逐步聚类构建遗传资源群体的核心子集,并检测一系列核心子集的代表性评价参数.采用包含8个农艺性状和60个SSR标记信息的水稻群体数据验证混合遗传距离的有效性.结果表明,采用混合数据构建的核心子集比单纯的基因型值数据构建的核心子集更有代表性.主成分分析结果验证了该结论的可靠性.

关键词： 核心子集 逐步聚类法 混合线性模型 基因型值 分子标记信息