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应用混合遗传距离和基因型值遗传距离构建植物遗传资源核心子集(英文)

文献类型: 中文期刊

作者: 王建成 1 ; 胡晋 2 ; 徐海明 3 ;

作者机构: 1.山东省农业科学院作物研究所

2.浙江大学农业与生物技术学院种子科学中心山东省农作物种质资源中心

3.浙江大学农业与生物技术学院

关键词: 核心子集;逐步聚类法;混合线性模型;基因型值;分子标记信息

期刊名称: 生物数学学报

ISSN: 1001-9626

年卷期: 2011 年 02 期

页码: 269-278

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 将连续性的基因型值数据和间断性的分子标记数据整合建立混合遗传距离,对比了应用混合遗传距离和单纯应用基因型遗传距离构建植物遗传资源核心子集的效果.应用混合线性模型中的调整无偏预测法(AUP)预测基因型值,结合不加权类平均法(UPGMA)逐步聚类构建遗传资源群体的核心子集,并检测一系列核心子集的代表性评价参数.采用包含8个农艺性状和60个SSR标记信息的水稻群体数据验证混合遗传距离的有效性.结果表明,采用混合数据构建的核心子集比单纯的基因型值数据构建的核心子集更有代表性.主成分分析结果验证了该结论的可靠性.

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[1]植物遗传资源核心种质新概念与应用进展. 王建成,胡晋,黄歆贤,徐盛春. 2008

[2]应用微核心种质进行作物重要经济性状的评价. 王建成,段乃彬,李群,颜廷进,张文兰,戴双. 2008

[3]蒙特卡洛模拟在种质资源研究中的应用探讨. 王建成,胡晋,黄歆贤,徐盛春. 2009

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