基于重测序的大豆新品种齐黄34的全基因组变异挖掘

张彦威; 李伟; 张礼凤; 王彩洁; 戴海英; 徐冉; 《中国油料作物学报 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：为全面揭示大豆优良品种和重要亲本的全基因组突变类型,采用高通量重测序技术,对大豆品种齐黄34进行全基因组重测序,测序深度13×,共检测到1 519 494个单核苷酸多态位点,357 549个小片段插入缺失位点,4 506个结构变异;这些变异共导致了17 748基因变异;大量光周期相关的重要基因发生突变,其中包括CRYPTOCHROME 2、GIGANTEA、Timing of CAB expression 1、E1、PHYTOCHROME A、Flowering Locus T、CONSTANS、Terminal Flower like等,齐黄34为E1基因型。本研究为分子标记辅助选择提供了重要的标记资源。

关键词： 全基因组重测序 单核苷酸多态 小片段插入缺失 结构变异 基因变异