您好,欢迎访问山东省农业科学院文献资源数据库平台

基于重测序的大豆新品种齐黄34的全基因组变异挖掘

文献类型: 中文期刊

作者: 张彦威 1 ; 李伟 1 ; 张礼凤 1 ; 王彩洁 1 ; 戴海英 1 ; 徐冉 1 ;

作者机构: 1.山东省农业科学院作物研究所

关键词: 全基因组重测序;单核苷酸多态;小片段插入缺失;结构变异;基因变异

期刊名称: 中国油料作物学报

ISSN: 1007-9084

年卷期: 2016 年 38 卷 02 期

页码: 150-158

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为全面揭示大豆优良品种和重要亲本的全基因组突变类型,采用高通量重测序技术,对大豆品种齐黄34进行全基因组重测序,测序深度13×,共检测到1 519 494个单核苷酸多态位点,357 549个小片段插入缺失位点,4 506个结构变异;这些变异共导致了17 748基因变异;大量光周期相关的重要基因发生突变,其中包括CRYPTOCHROME 2、GIGANTEA、Timing of CAB expression 1、E1、PHYTOCHROME A、Flowering Locus T、CONSTANS、Terminal Flower like等,齐黄34为E1基因型。本研究为分子标记辅助选择提供了重要的标记资源。

  • 相关文献

[1]鸡mir-1644基因“seed”区的T>C多态分析. 耿立英,张传生,尹春光,曹顶国,杜立新,陈娟. 2011

[2]鸡microRNA基因“seed”区4个SNPs的群体遗传分布. 耿立英,张传生,尹春光,曹顶国,付志新. 2011

[3]'鲁丽'*'红1#'苹果杂交群体全基因组KASP标记开发及验证. 郑文燕,常源升,何平,何晓文,王森,高文胜,李林光,王海波. 2023

[4]鸡传染性支气管炎病毒变异株的分子特征和抗原性分析. 胡北侠,文心田,杨少华,曹三杰,许传田,张琳,黄艳艳,张秀美. 2012

[5]基因Ⅶ型新城疫强毒对樱桃谷鸭的致病性试验. 胡北侠,场少华,许传田,张琳,袁朋,张会娟. 2012

[6]H9N2亚型禽流感HA基因变异对其抗原中和能力的影响. 刘娟,徐怀英,张伟,黄兵,李玉峰,秦卓明. 2012

作者其他论文 更多>>