科研产出
马铃薯栽培品种‘合作88’细菌人工染色体文库的构建与评价
《园艺学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：以四倍体马铃薯栽培品种‘合作88’培养12~15 d苗龄的幼嫩叶片为试材,提取高分子量基因组DNA,利用限制性内切酶HindⅢ部分酶切后回收100~300 kb片段,连接到载体Copy ControlTM p CC1BACTM的HindⅢ位点上,构建了细菌人工染色体(BAC)文库。该文库约由850 000个克隆组成,空载率约2.08%,保存在1 700个混合池中,克隆插入片段平均大小约为90 kb,覆盖单倍型马铃薯基因组约85倍。随机挑取6个BAC克隆连续培养5 d,提取DNA进行HindⅢ完全酶切检测,确认不同培养时间的BAC克隆的指纹图谱完全一致,表明文库较好的稳定性。BAC文库的构建为马铃薯重要农艺性状基因克隆、基因组测序以及比较基因组研究等奠定了基础。
马铃薯栽培品种'合作88'细菌人工染色体文库的构建与评价
《园艺学报 》 2015 CSCD
摘要：以四倍体马铃薯栽培品种'合作88'培养12 ~ 15 d苗龄的幼嫩叶片为试材,提取高分子量基因组DNA,利用限制性内切酶HindⅢ部分酶切后回收100 ~ 300 kb片段,连接到载体CopyControl~(TM)pCC1BAC~(TM)的HindⅢ位点上,构建了细菌人工染色体(BAC)文库。该文库约由850 000个克隆组成,空载率约2.08%,保存在1700个混合池中,克隆插入片段平均大小约为90 kb,覆盖单倍型马铃薯基因组约85倍。随机挑取6个BAC克隆连续培养5 d,提取DNA进行HindⅢ完全酶切检测,确认不同培养时间的BAC克隆的指纹图谱完全一致,表明文库较好的稳定性。BAC文库的构建为马铃薯重要农艺性状基因克隆、基因组测序以及比较基因组研究等奠定了基础。
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石麦15细菌人工染色体文库构建与鉴定
《麦类作物学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：为给小麦功能基因研究提供参考信息,以冬小麦栽培品种石麦15(Triticum aestivum L.)为试材,从暗培养7~10d的黄化幼苗地上部提取高分子量基因组DNA,使用载体pCC1BAC的HindⅢ位点构建了六倍体小麦细菌人工染色体文库。该文库由1 000 000个以上克隆组成,保存在1 020个混合池中,克隆插入片段平均大小为85kb,空载率为2.5%;覆盖小麦基因组5倍以上;挑取7个克隆培养5d后,经HindⅢ完全酶切检测,其指纹图谱稳定一致。石麦15细菌人工染色体文库的构建为小麦基因克隆、调控序列克隆以及比较基因组学研究奠定了基础。
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玉米自交系齐319细菌人工染色体文库的构建及鉴定
《农业生物技术学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：玉米(Zea mays L.)病害的发生和流行一直是影响其生产的限制因素,玉米南方锈病、粗缩病是我国东南玉米区及黄淮海夏玉米区的重要病害。尽管目前已经开展了对两种病害抗性基因的遗传规律、染色体定位等相关研究,但对这些基因的克隆及功能鉴定等研究进展缓慢,构建抗性材料BAC文库并对抗病基因进行克隆是目前较为有效的方法之一。本研究以黄淮海夏玉米区优良抗病玉米自交系齐319为材料,利用CopyControl pCC1为载体,通过高分子量DNA的提取、部分酶切与大片段DNA的选择、连接转化等多个方面的优化,构建了玉米细菌人工染色体文库。该文库包含270 720个克隆,平均插入片段大小约90 kb,空载率为1.3%,约覆盖玉米基因组10.43倍。文库构建为这些重要功能基因的克隆及比较基因组学研究提供了基础资料。
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大白菜细菌人工染色体文库的构建及鉴定
《园艺学报 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：以我国优良的大白菜自交系‘85-1’为材料,利用pIndigoBAC-5为载体,通过对高分子量DNA的制备、大片段DNA的选择、连接转化条件等几个方面的优化,构建了大白菜细菌人工染色体文库。该文库由57600个克隆组成,平均大小为98.4kb,空载率为1.5%;覆盖大白菜基因组10.3倍;挑取6个克隆培养5d后,经HindⅢ完全酶切检测,其指纹图谱稳定一致。大白菜细菌人工染色体文库的构建为重要功能基因的克隆和定位及比较基因组研究奠定了基础。
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