科研产出
莱芜猪和杜长大猪盲肠和结肠微生物菌群结构组成和功能分析
《畜牧兽医学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：旨在研究莱芜猪盲肠和结肠肠道微生物群落的结构组成、功能以及与杜长大猪的区别，为从肠道菌群层面深入理解莱芜猪高脂肪沉积、耐粗饲和抗逆等特性奠定基础。以12头莱芜猪和6头杜长大猪为试验动物，采用高通量测序技术测定盲肠和结肠微生物菌群16S rRNA V3-V4区序列，分析微生物菌群的组成、丰度和多样性，预测生物功能，通过对莱芜猪和杜长大猪菌群丰度比较分析、LEfSe物种差异判别分析、微生物菌属与背膘厚和血清生化指标相关性分析，鉴定影响莱芜猪品种特性的微生物菌属。结果发现：1)莱芜猪的背膘厚和血清总蛋白、甘油三酯、葡萄糖、高密度脂蛋白胆固醇等指标与杜长大猪存在显著性差异（P＜0.05）。2)莱芜猪具有与杜长大猪不同的盲肠和结肠微生物菌群多样性和相对丰度，莱芜猪盲肠微生物菌群的Simpson指数显著高于杜长大猪（P＜0.05）,盲肠的厚壁菌门（Firmicutes）的相对丰度显著低于杜长大猪（69.16%vs. 89.59%,P＜0.05）。3)盲肠和结肠中一些微生物菌属的丰度与背膘厚和部分血清生化指标具有显著相关性（P＜0.05）,且与这些表型指标相关的盲肠微生物菌属比结肠更多，相关系数也更高，表明盲肠微生物菌群对猪的表型起到了更大的作用。4)甲烷短杆菌属（Methanobrevibacter）、梭杆菌属（Fusobacterium）和大肠杆菌-志贺菌属（Escherichia-Shigella）、活泼瘤胃球菌（[Ruminococcus]＿gnavus＿group）、拟杆菌属（Bacteroides）等与脂肪沉积、耐粗饲和抗逆性强等有关，可能是影响莱芜猪特性的微生物菌属。本研究阐述了莱芜猪和杜长大猪盲肠和结肠微生物菌群特征，加深了肠道菌群对莱芜猪品种特性影响机理的了解，为地方猪肠道微生物资源的开发与利用奠定基础。
关键词： 莱芜猪 16S rDNA高通量测序 微生物菌群 盲肠 结肠
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